SEARCH OPTIONS

lncRNA id
CNCI status
Max. peptide length
Is conserved?
Organ-specific expression:
Max. expression
No. of exons
Order results by

Current search details:

Found 6583 records

CNCI status:   #
Max. peptide length:   #
Is conserved:   #
Organ specific:   #
Max. expression:   #
No. of exons:   #
Order by:   lncRNA ID


Record details CANTATAdb ID Species Location CNCI status (score) Swiss-Prot best hit Max. peptide length Max. expression No. of exons Notes
CNT30513873 Juglans regia 4:541173-541780 (+) coding (0.14)- 96 3.71 2
CNT30513872 Juglans regia 4:28672710-28675417 (+) noncoding (-0.043008)- 93 56.03 4
CNT30513871 Juglans regia 4:16272816-16279555 (-) noncoding (-0.0385024)- 57 0.7 6
CNT30513870 Juglans regia 4:18209417-18213527 (-) noncoding (-0.024576)- 75 1.64 1
CNT30513869 Juglans regia 4:23939614-23940277 (+) coding (0.029)- 39 21.15 2
CNT30513868 Juglans regia 4:16274170-16279537 (-) noncoding (-0.02048)- 58 1.74 5
CNT30513867 Juglans regia 4:30046130-30050998 (+) noncoding (-0.0139264)0.0000000001 (sp|Q93ZJ3|NFD6_ARATH) 97 6.15 3
CNT30513865 Juglans regia 4:2668622-2695030 (+) noncoding (-0.018432)6e-41 (sp|Q9ZW30|GSTU1_ARATH) 76 1.52 2
CNT30513864 Juglans regia 4:16272787-16279555 (-) noncoding (-0.077824)- 66 0.48 4
CNT30513863 Juglans regia 4:24831478-24832620 (+) coding (0.162)- 90 1.8 2
CNT30513862 Juglans regia 4:19084650-19095143 (+) noncoding (-0.0196608)- 88 3.25 6
CNT30513861 Juglans regia 4:19489882-19492327 (+) noncoding (-0.0311296)- 99 9.51 4
CNT30513859 Juglans regia 4:5676641-5677821 (+) noncoding (-0.032768)- 87 5.82 3
CNT30513856 Juglans regia 4:6217617-6249969 (+) noncoding (-0.0692224)- 32 3641.32 2
CNT30513854 Juglans regia 4:20178985-20185388 (+) noncoding (-0.043008)1e-18 (sp|C0LGP4|Y3475_ARATH) 59 3.25 2
CNT30513852 Juglans regia 4:25784289-25784820 (-) noncoding (-0.045056)- 67 0 2
CNT30513851 Juglans regia 4:12722447-12763707 (+) coding (0.001)- 69 165.49 2
CNT30513850 Juglans regia 4:11376170-11380747 (-) noncoding (-0.176128)- 66 13.56 5
CNT30513849 Juglans regia 4:4103117-4104730 (+) noncoding (-0.0004096)- 42 4.06 2
CNT30513848 Juglans regia 4:9112872-9116799 (+) noncoding (-0.077824)- 87 3.51 2
CNT30513846 Juglans regia 4:16272810-16279555 (-) noncoding (-0.077824)- 72 18.27 6
CNT30513845 Juglans regia 4:26296616-26303589 (+) noncoding (-0.0004096)- 91 0 3
CNT30513844 Juglans regia 4:25784289-25784820 (-) noncoding (-0.098304)- 63 0.33 2
CNT30513843 Juglans regia 4:1869182-1870652 (-) noncoding (-0.0335872)- 94 19.07 2
CNT30513842 Juglans regia 4:21362080-21362635 (-) noncoding (-0.008192)- 90 2.97 1
CNT30513841 Juglans regia 4:20460079-20466505 (+) noncoding (-0.0004096)- 36 1.36 3
CNT30513840 Juglans regia 4:13146065-13151845 (+) noncoding (-0.176128)- 80 13.58 4
CNT30513839 Juglans regia 4:27607073-27608046 (+) noncoding (-0.024576)2e-57 (sp|Q01908|ATPG1_ARATH) 68 0.5 2Conserved counterparts:
CNT30513838 Juglans regia 4:32789188-32791952 (-) noncoding (-0.008192)- 59 5.76 3
CNT30513837 Juglans regia 4:27654265-27656431 (-) noncoding (-0.0135168)2e-76 (sp|Q9SB81|PER42_ARATH) 96 25.83 3Conserved counterparts:
CNT30513836 Juglans regia 4:30218941-30221214 (+) noncoding (-0.008192)- 62 37.67 1
CNT30513835 Juglans regia 4:17635945-17640083 (-) noncoding (-0.0233472)- 70 4.38 3
CNT30513833 Juglans regia 4:17364381-17376522 (+) noncoding (-0.0004096)5e-30 (sp|I3V6A7|SOMT1_PAPSO) 78 97.02 3
CNT30513832 Juglans regia 4:1316320-1317143 (-) noncoding (-0.0188416)- 91 8.3 2
CNT30513831 Juglans regia 4:9865648-9866405 (-) noncoding (-0.0004096)- 58 9.11 1
CNT30513830 Juglans regia 4:34271173-34271567 (-) noncoding (-0.16384)- 94 13.25 2
CNT30513829 Juglans regia 4:1807277-1807731 (-) noncoding (-0.0004096)2e-30 (sp|Q9SRM3|JOX1_ARATH) 50 2.26 2
CNT30513827 Juglans regia 4:16274170-16279537 (-) noncoding (-0.022528)- 58 3.93 5
CNT30513826 Juglans regia 4:16272804-16279620 (-) noncoding (-0.0417792)- 79 0.24 5
CNT30513825 Juglans regia 4:7611348-7614453 (-) noncoding (-0.0815104)- 80 4.6 2
CNT30513824 Juglans regia 4:16272806-16279589 (-) noncoding (-0.12288)- 72 2.21 5
CNT30513823 Juglans regia 4:17635945-17640083 (-) noncoding (-0.0233472)- 70 4.87 4
CNT30513822 Juglans regia 4:3040114-3041050 (+) noncoding (-0.022528)- 63 12.22 2
CNT30513821 Juglans regia 4:30213980-30217023 (+) noncoding (-0.18432)- 91 32.01 3
CNT30513819 Juglans regia 4:151799-153255 (+) noncoding (-0.0004096)- 78 11.94 3
CNT30513818 Juglans regia 4:12901681-12911191 (+) noncoding (-0.0643072)- 64 5.18 2
CNT30513817 Juglans regia 4:10499958-10505257 (+) noncoding (-0.004096)- - 51.09 2
CNT30513816 Juglans regia 4:24631971-24636648 (+) noncoding (-0.036864)- 73 3.53 4
CNT30513814 Juglans regia 4:9593875-9597307 (-) noncoding (-0.0339968)- 80 11.48 3
CNT30513813 Juglans regia 4:29134694-29135784 (-) noncoding (-0.188416)- 57 42.5 1