Detailed information on CNT0019904


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9M3G7|ATM_ARATH, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potentially orthologous lncRNAs
:
CNT0032689 in O. sativa

Most similar lncRNAs
:
CNT0042646, E-value = 5e-10 (A. thaliana)
CNT0033897, E-value = 2e-06 (P. patens)
CNT0001712, E-value = 2e-24 (G. max)
CNT0032689, E-value = 0.0 (O. sativa)

Expression of CNT0019904

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
MMQMCGTLMVELASNGCAPLSAHLFATVKIPS*

>peptide 2 (40 aa)
MMLITVSGCIWLGKSSCYSKHGKGTMNYLMMFAQALVPRW*

>peptide 3 (61 aa)
MPLRIAAAVKLIIWRRFVFSKHAYVMSQKFSCFDGWPAIGAVSIHHTIVQRTFSCFDGCIP*

>peptide 4 (29 aa)
MPPYTSSGDYPATNAPRAHGIHERICGFK*

>peptide 5 (31 aa)
MEFVLLLSKALLNYLMNSWWQFLSCFVRSLV*

>peptide 6 (47 aa)
MITGFLKMNYPTLWKLCQKSLWILVPRLCLINATLYIFRGLSSNQCS*

>peptide 7 (33 aa)
MSLDLFMLLKKPELSLLILSRMVDLLDQKVDHQ*

>peptide 8 (35 aa)
MFYLKTHQVITLILCGRRFLMDLVQSSYILGRRES*

>peptide 9 (35 aa)
FPKAPTNPSGLVPSASRRAASLMRSPPAAASQPKP*

>peptide 10 (31 aa)
MTPKNLTMATRMQLELYFVLNRSWMDMKMAR*

>peptide 11 (66 aa)
MCLMSTVKVYLTKRGVFNKTRSLLISNMKLLGGQEIGISPFSFHILLGLQPALEVAVFSMKIYIVA*

>peptide 12 (29 aa)
MRFYSLVCFFPSPPCQHSYKVQQTAFGTL*

>peptide 13 (3003 aa)
VPKSPHKPLGPRPLRLSPRGFPDALAPRRGLPAETLAPIPIPMAAVATARDVEEVVQKLQSDRARVRDEGVKLLGTWLQGDRAASFCRLLGRNTVRFKPG
HGNLTGGHSLHLLSVAKQLFVHIWEVIKDGPSLQLEYSIILRQLLNVKEYRYQMKPRTYSNFVSLYMKKVASAFDAKFSNQASSKDESFRCTLTLHVLLE
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KEALLTIIEVFVHDPLYKWALSPLKALQRQKETVDTDSCLDDSQEPYDGNKDAARAILRVKQKLDGYEDGEMRSVQGQVQQLIQDAVDVDRLCQMFPGWG
PWL*

>peptide 14 (36 aa)
MDGSLCYCFLSGLQMHNKDSKQGEKDEERTHYEPYR*

>peptide 15 (29 aa)
MDLLSQTTLLNIVVHGFSLSSFSGVMVLI*

>peptide 16 (35 aa)
MQNFVKLRWILSWLCQTLARRARNTSTLPSLNYRF*

>peptide 17 (100 aa)
MISLKNTWLRSLPFCSLFLHLLMGHKFHIFPRRMLHFQSEWLLMDLWTQWMITWLIQLLVIKLIYFVLTEFLSSCCRYISKLQMPAIPGTWVIVFVQLRF
*

>peptide 18 (36 aa)
MQMPYVFRIHYSGFSGHSRSSPQCSCLTLGIKCNFV*

>peptide 19 (29 aa)
MEARSSLHYFNFFLSFITSYMGNFVQLGG*

Sequence

>CNT0019904
CGTTCCCAAAAGCCCCCACAAACCCCTCGGGCCTCGTCCCCTCCGCCTCTCGCCGCGCGGCTTCCCTGATGCGCTCGCCCCCCGCCGCGGCCTCCCAGCC
GAAACCCTAGCTCCGATTCCCATACCGATGGCGGCCGTGGCCACTGCGCGCGACGTGGAGGAGGTCGTCCAGAAGCTTCAGTCTGATCGGGCCAGAGTCC
GCGACGAGGGGGTGAAGCTGCTGGGGACATGGCTGCAGGGTGACCGCGCTGCGTCCTTCTGCCGCCTCCTCGGCCGCAACACCGTCAGGTTCAAGCCCGG
CCACGGGAACCTTACCGGAGGGCATTCACTACATTTGCTCTCAGTTGCTAAGCAACTTTTTGTTCATATTTGGGAGGTCATAAAAGATGGCCCTAGCCTT
CAGTTAGAGTACAGCATAATCCTTAGACAGCTTCTAAATGTGAAGGAGTACCGCTATCAGATGAAACCTCGAACATATAGCAATTTTGTATCACTCTACA
TGAAGAAGGTTGCTAGTGCTTTTGATGCAAAATTCAGCAATCAGGCGAGCTCCAAGGATGAATCCTTCCGCTGTACATTGACACTTCATGTTCTACTTGA
AAACCCACCAAGTGATTACCCTGATATTATGCGGGAGGAGGTTCTTAATGGATTTAGTGCAATCTTCTTACATATTAGGGAGGAGGGAAAGCTGACTCGC
AAACTTATGGAATGCATTAACACCTTTTTACTGAAGGATGGGCCAAATCTGGGATACAAATCTGTGAAGATCCATAATGCAGTTCAAGAGTTTATATTCC
GTTGTTGGATGACAACTCATGATCAGGCCTTGAAGAGTTTGTTCATAACCTACGTGAAAGTTCAGCTGAAGATTGCCAGGAATATTCCAGAGATTTTGGA
AAAACTTATTGATGTCATCATTAAGGAACTAGACAAAAATGTTAACACTGGACCTGGACTTCTATGGTGTGAGGCACCAAGAGATGAGAAAGCTGTGTCC
TTAAGGTGTTTCCAAGAGGAATGGATGGATCTCTCTGCTACTGTTTTTTATCTGGCCTGCAAATGCACAACAAAGACAGCAAACAGGGAGAAAAGGATGA
AGAAAGAACACATTATGAACCTTATCGTTGATGGCCTTTTTAGAGGATCTTTGTTTTGGAGTGGTTCTGTTTGTTTTCTGATTCACAAGTATGGATATCA
TCTAGAGAAATCTTTGCTAATTAGTTGGTTTGAAGCAAGTTGCAAAGCTTTGAGAAGTATCTTGATCCATGCAAATGCCATACGTTTTCAGGATTCACTA
CTCTGGCTTCTCAGGACATTCAAGGAGTTCTCCACAGTGCTCATGCTTGACACTAGGGATAAAGTGCAATTTTGTTTAACAAAAGGCGAGATGTCAATTG
TTGAAGATTGTTGGCAAGCCATATGGAATTCCCTTGTTCACGCATTTCCGTTGTTAAGCAGCATAGATCTAGTTGCTGATTCAGCTCTGATTTTGCTGGG
TGGAATGATCATGCGGGACCAAGTTCATACATCATTTCTATCAGAAGATACATGGAACCTGCAAATATTTAAAAAATTTCCATCGCCGTCTGCTCTGTAT
TTTGTTGCCTGTTACTTCTCGAGGATAGGCTTTCAGGGTGACTTATCCAATTCTATCTTTGTTCGGAAGACTCTGCTAAGGTCAACTTTGGAGTTAATTC
ATTCAAAGGAATTCTCTCTTTTGAATGAACAAAATGTTGTTATCATTCCTGAAGCTATTTTCTCGCTGTGTGCTGGCTTTTCATCACCAGTAATTAATTC
ATCGGATATATTGCAACTGTTTGGTCATTGTAAAATTCATTCCAAGATGTCTCTTGAGGATGATAACTGGGTTCTTAAAGATGAACTACCCTACTCTGTG
GAAGCTTTGTCAGAAATCACTCTGGATACTTGTACCAAGGTTATGTCTCATAAATGCCACCTTATACATCTTCCGGGGACTATCCAGCAACCAATGCTCC
TAGAGCTCATGGAATTCATGAAAGGATTTGTGGCTTCAAATGAGCAGTTTGAGAAAGTGGACTTGAATAATCTTGTTCTTGTTTGTTCTCTTCTCTGCAA
TCTGATTCATTGTGCATTGTTGTCAAGGACCATGGAAGAAAAATCTTCACTTTTGCAAGAAACAGTAGATTATGTCACCAATATTTTAAAACATATTGTG
TCATTTGTTGTGAAGAAGAATGATGAACTTTCTCATGGTCTTACTAACATAAGTTCAGCATTGGATACAATGGGCTCTGCTTTCTCCTCAATCAAGAGCT
TACTGTCTTCTCCAATATTTAATCTGTCAAGAGTTGATAATGGAGTTTGTTCTGTTGTTATCAAAAGCATTACTGAATTACTTGATGAACTCTTGGTGGC
AATTTCTCAGCTGTTTTGTCAGATCTCTAGTTTAGTGAGCAATTTTGATGCAGAGAGTACTGGTAAAATGCTACCAACATCTAGTATCAATTTAGAGGAC
CTAAATCCTGTTTTGGACTGTAAAAGTAGTGTTGCTGATATGGATCTTGATGTGATGGACTCTAGTGAAGTAGATTCTGTCACAGCTAGTGCGAGTGGAA
GTATGGGTAGCTTCTTACGACCTTTGGAATGGAAGCTAGATCTAGTTTGCATTATTTCAACTTTTTTCTCAGTTTCATCACTTCATACATGGGAAATTTT
GTACAGCTTGGTGGATAAAGAAGGTGACGTGAAGGTTCGCCAGGCCATCTTGCTTAACCTTTGCAGAAACATCTCCGCGTCATCTAAAACTGTATCTTTA
GTGGTCCATTTTATAGTTGATATGAGGGACAGAGGTGCAAGTTCATTACTTGGACCTGCAGAGTGCTTAACTCACATACATGCTTTATTAAAAGCGTTGA
TAGCTATCCATGGTGGACAGAATGCTGATGGAAAGCAACCAGGACGCGAAGTATTTTTCAGTGAGAACCAGGATATCTTATTTGACTTGTTAAATAGGGC
TACAGACATAAGTTCTGTAGATTGGTTTTCTCGCATCAAGTTCATTGATTGTGTCTCCTCCTTTGTTTGCCTGTTCCCTGATGTTGCCCAGGATTTGATC
GGATGTTTGCTTGACATGCTGCATGATGCTGATTACCGTGTCAGGTTGTATTTGGCTAGGCAAATCGTCGTGTTATTCCAAACATGGGAAGGGCACAATG
AATTATTTAATGATGTTTGCTCAAGCATTGGTGCCAAGATGGTGAAGTTCTCAAATATTTCTCCAGTTACAGCTAGAGAAGTCTTAGCTGTTGGTCCACA
ATCTGTTCTCGTAATTGAAACTGCTCTCATTACACTAGCTCATTTGGCTGTGCATAGCGAGGATGTTGAAGTTGAGTGTTTGTTCATGATTTCTGCTGCG
GCTGCTATAGAGCCTTCTCAGCGAGAATTAGCTTTTGCGTTATTTGATTCCATTTCAAGGAGGCTTGGTTATGCTTCAAGAAGCAAGTATCTGGACCAAG
TGATGGGCCCGATTCTTTTTCGATGGGTTGCTTGTGAGATGAATCTAATTTCACTTGTTGAGGTGCAAGAAATGTTTGGTTATGGATCTGCTGAGCCAAA
CAACTTTGTTGAACATTGTAGTTCATGGCTTCTCCCTTTCCTCATTCTCAGGGGTGATGGTGCTGATATGAATTGGATATCGAAGATTTTATCTCAACCT
TTGTCAATCATTATCAAGAGATACTTCGTTCCAATCTTTGGAATGTGCATTGCTGTCAGATGTGGCACAGGGCCAGAGAAGGACTTAGCTGAAACTGTCT
TATGTGAATCAGTTTTGCAGCTTGGTGAAATTTCTGAACTTGAGCGTGATGATCTCATTAAAAAACACATGGTTGCGATCGTTGCCTTTTTGCTCTCTGT
TTCTTCATCTGCTCATGGGCCACAAATTCCATATTTTTCCAAGAAGAATGTTGCACTTTCAGTCAGAATGGTTGTTGATGGATTTGTGGACACAATGGAT
GATAACTTGGCTGATACAGTTGTTAGTGATAAAGTTAATATATTTCGTGCTGACAGAGTTTTTAAGTTCCTGTTGTCGATACATCAGCAAGTTGCAGATG
CCAGCCATTCCAGGCACATGGGTCATCGTCTTTGTGCAATTGAGGTTTTAATAGATGTACTTGGGCACAGAGTGGTTCTTGAGAGCACTTGCTTCTATAT
TATTTCTATAGTGGGGAACTATATTCAGCAAAAACCACTGCAAGGCCAGTGCTGTAATATTTTGTCTAAATTGTTGGCTGCTTTTGATGGAAACACCTCT
GCTGAAACCCTGCAAGTGCTTGGCAGACAGCTTCAGGTAGTAGTTCCAAAATTAATTTTTTCCTGCCTAATTAATGAGAAAGAAGAAAGAAGTGGTACTG
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TGATTGCTTGAAAGATGTACAGGAGTTTCATGCTTCACTTTCTGCCTCACATTCTTCAAGGAATCAGTTCTTAAAGTTTGTTAATAAGGCTCCTTATTTA
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TGGTTAGCTGCTGGCATAGTGACCCAGATGTCATTTCTGCTGTATGGGCTCTTGTTGACATTTGTAGCTCATCATCTGTAGCAAATGAAGCTTCTTGGGT
GCTTGCTGATTTTATCTCTAGGGCTGGTATATCTGATGCACATCAAGTAATATTCCGTCTGCCAACTACCACCGAAAATTATTCTTTACAACTACATACT
GGTTCTGCTTCCAAGGAGGATAAATTATCCACAAACTATGGTATTTCTGATGATGTTCTGGTTGGGCTTTTGAAACTCTTGAAGACTTATTTATCTGATG
AATCTGTTGAAATAATAGATGCTGCTTCACAAACACTGAGGGGTATTCTGTCAACAGCACGGGGGCTCAATGCTCTGCAGTTTCTTGATTCTCCCGATAG
GTCTTTACTCATGGTTCATTCGAGAGGGGTAAACATTCAGATAGTTGAACAGACTATATCACAAATGGAACAGTGTGCTGGTGTTTCACTTGATGATGCA
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GGAGTATTGTTTTTGTCAAAGTTAAGGCTGCTGAGCTTTTGCTTTCTAGTACTCTAGTGAACATTGCTGGCAATGTTGATTCTAATACTGCCATCTGCAA
ATTAATTTCAACAAAGGTTGAGAAAATAATTTTTTCCGACTCCAATCATTCATTGAAGTCAATCCATCTGTTTCTGGATGCACTGAATGTCATTAGATCT
TTTTATGTTGCTGAAAAAGCCAGAACTTTCCCTTCTAATACTCTCAAGGATGGTAGATCTGCTAGATCAAAAAGTCGATCACCAGTGACAACCCCATCAT
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GCTTTGGTGTGAGGAACAATTCAATAGGCTGGTATTAGGACCTCCAGAGTTTTCCAATGAAGAGTTGTTGCCACCTCATGTTGATCTGTTGGTTGCTGCA
TTTACTCGTATAAATGAACCAGACAGCATTTATGGGCTCACACTATCTAATGAGATAGCGTCTCAGCTTATTAGGTATGAGCATGAAGGTGATTGGAGTA
GCGCACTTGAATACTATGATTTACTTGTAAGGTCAATGCCAAAGGAACACCTTGGCACTTTAACTGGGTCGGTGTTGACTGGACCATCTACCGTGTCTTC
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GGTTTATCTCACCAAAAGGGGTGTCTTCAACAAGACGCGGAGTTTATTGATATCCAATATGAAGCTGCTTGGAGGGCAGGAAATTGGGATTTCTCCTTTT
TCGTTCCATATTCTTCTTGGTCTTCAACCCGCTCTCGAAGTAGCTGTCTTTTCAATGAAAATTTACATAGTTGCTTAAGAGCTCTGCAGAACGGTGATTC
TGAGGAGTTCCATGCAAAACTTTGTCAAACTAAGATGGATCTTGTCTTGGCTTTGTCAAACACTAGCAAGGAGAGCACGAAATACATCCACTCTACCATC
CTTAAATTACAGATTCTAGATCATGCTACTATGGTTTGGGACCTGCGTTGGAACCTTAATCCCAATCAAACTTCAAAATCTCCTGTAACCAAGGAATTTT
CTCACATATCTACTGTCCCTAAAGGGATACAGTTGGAGTTGTTGGATAAAGAGTGGAACTTAATTATGTTCCAAGCAGAACGGAATCTTGATCTATTTGA
ACCTTTTCTGGCATTTAGGCGTGCCCTCCTTAAGATTTTAGGTTGTGAAGAACATCTTGTAAAACATTTATTTCAATCTGCTTCTGCGCTCCGGAAGGGA
TTAAGGTTTTCTTTGGCAGCGGCAGCTTTATATGAACTCAAAGAACTTTGTTTTCACAGAGATGAGAGCACTATGACAAATACCTATTTGCTTGCACGGC
TTGAAGACGCTAAATTGCTCAGAGCTCAAGGGCAGCATGATATGGCTATTAGTCTTGGAAAATACATACTACAGAAGCTTTCTGACAAGAAAAACCTGTC
AGATGTCTATCGATTAGTTGGCAAGTGGCTGGCTGAAACAAGATCAAGCAACTCAAGAACTATCATTGAGGACTATTTAAGACCTTCTATAGATCTCTCT
GAATTTGAGAAGAGTACAGATAAAAGGTACATGTCCAGGCAGTGTCGAACACATTTCCATCTAGCACATTATACATATAGTTTGTTCAGAAGCTATGAGG
AAAGACTCTCATCTAACGAATGGCAAGCAGCTCTGCGATTAAGGAAATACAAGACTAGGGAGTTGGAGATACTGATTAAAAGACTGAGAAGTTCATCTAA
GGGTGTGAAGACTGATTACTCAGTAAAAATCCAAGAGTTACAGAAACAACTTGCACTTGACAGAGAAGAAGCAGAGAAAATACAGGATGATCACGATAAT
TTCTTAAATCTAGCACTTCAAGGCTACCAACGTTCCATTGTTGTTGGTGGCAAATATGACCTACAAGTGGTTTTTCGGTTGGTCTCGTTGTGGTTTAGTC
TTTTCTCAAGGGATCAAGTTGTGAAAGCAATGTTGAAAACCACAAAAGAGGTCCAAACCTACAAGTTCATACCACTGGTTTATCAAATTGCTTCGAGACT
TGGGAGCACCAAAGATGCTCAGGGGTCATTTAACTTTCAGATTGCGTTAGCTTCTCTTTTGAAGAAAATGGCTGTTGATCACCCATATCATACAATATTC
CAGCTTTTGGCTCTAGCAAATGGTGATCGTGTCAAAGACAAGCAAAGAAGTAGAAGTTCTTTTGTTGTAGATATGGAGAAGAAGCTTGCTGCTGAAAATT
TGTTAAAGGAGCTATCTTCCTGTCATGGACCTCTGATTTGTCAGATGAAACAAATGGTTGAGATCTACATTAAGTTAGCAGAACTGGAGACCAAGAAGGA
GGACACTAACAAAAAAATTCCGCTGCCCAGGGAGGCCCGCAGCATTGGTCAGCTTGAACTAGTTCCAGTTGTGACTGCTACCGTTCCTATTGATCCTAGC
TGTCGTTATGAGGAAGGCTCCTTTCCACATTTCACTGGGTTGGCTGACTCCATTATGATCATGAATGGAATTAATGCTCCCAAAGTTATAGAATGTTTTG
GCTCGGATGGTAACAAATACCGTCAACTTGCAAAATCTGGAAATGATGACCTGCGACAGGATGCTGTGATGGAGCAATTTTTTAGTTTGGTAAATACATT
CTTGCAAAATCACCGAGATACTTCTAAAAGGAGATTGAAAATCCGTACATATAAGGTTGTTCCTTTCACCCCAAGTGCTGGTGTTGTTGAATGGGTAAAC
GGTACTGTTCCACTAGGCGATTATCTAATTGGGAGTACTAGAAGTGGTGGAGCACATGGACGATATGGAATTGGGGACTGGACATATCTTCAATGCAGAG
AGTACCTGATGAGTGAAAAGGACAAAAGGAGGGCATTTCTTAAAATCTGCAGCAACTTTAGGCCTGTGATGCACCACTTCTTTCTTGAAAGATTCTTGCT
GCCTGCTGATTGGTTCCAAAGTAGACTTGCTTACACAAGGAGTGTAGCAGCAAGCTCGATGGTAGGATATATAGTCGGTCTTGGGGATCGCCATTCCATG
AATATTCTCATCGACCAAGACACAGCTGAGGTTGTACACATTGATCTTGGTGTTGCATTTGAACAGGGTCTCATGCTTAAAACACCTGAACGGGTTCCAT
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TAAAGAAGCATTGCTCACTATTATTGAAGTCTTCGTTCATGATCCTCTATATAAATGGGCACTCTCACCACTGAAAGCCTTACAGCGTCAAAAGGAAACA
GTTGATACTGATTCATGTTTGGATGACTCCCAAGAACCTTACGATGGCAACAAGGATGCAGCTCGAGCTATACTTCGTGTTAAACAGAAGTTGGATGGAT
ATGAAGATGGCGAGATGAGAAGTGTGCAGGGCCAGGTCCAACAACTCATACAGGACGCGGTGGATGTTGATCGGTTGTGCCAAATGTTTCCAGGTTGGGG
ACCTTGGTTGTAAGCTCCATTGAAAGGGATGTAAATTTTGATCGAAGGCAAGAGCAACTTTTTTCACTGCTTATGAGGTTTTATTCTTTGGTGTGTTTTT
TTCCCTCACCACCCTGTCAACATTCCTACAAAGTACAGCAAACGGCTTTTGGTACCCTGTAAATTGATGGGAAGGCAAGGACGACATTTGAGTGCAGGTG
GGTTGTACCACTCCTGTTTTAGAGCATGTCCAGACTAGAGGATGGGTGATTGCATAGTGAGGCCACAGTTTTCTTTTTTTGTTGAGCTTCATTAATACCC
CCTCTGTCTAAAAGTCCTCATCGTTTAAGCGTCCCGCACCAAGACCAAGGATGCCCCTCCGCATTGCAGCCGCTGTGAAGTTAATTATCTGGCGCCGTTT
TGTATTTTCAAAACACGCATATGTAATGTCGCAAAAATTCAGCTGCTTCGATGGTTGGCCGGCCATAGGGGCGGTATCCATACATCACACCATCGTGCAG
CGTACATTCAGCTGCTTCGACGGTTGCATACCGTAGTTTTTGTTCAGGATTTACTTTGTAAAGAAGTGAGGCTGTTTTGTCATGTATGTAAAGGGCTTGT
TTCGATGTAGCATGAAATACGAAGAATTATGATGCATTTGAATATACCGTGCTCC