Detailed information on CNT0031500


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LYZ2|FBL80_ARATH, E-value = 1e-08

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

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CNT0038248, E-value = 1e-07 (S. moellendorffii)

Expression of CNT0031500

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MLPVLLACLGLFYVYGGAVPTSPSVCKLWA*

>peptide 2 (57 aa)
MLDLCYCYLHLVFPPLFFFMCYITSPIQLKLVATLYILQKDRTQPPPVCSSLQKSSS*

>peptide 3 (34 aa)
MCFGLLLISFCNLRCVVILFQVIGGLLYSGLCFG*

>peptide 4 (30 aa)
MVLQMQTPIIISIIGLRLLLHLELKNSPLG*

>peptide 5 (42 aa)
MSSTVLEKKSHRFAKEYLCSIGGVFFPLIYCSNKLQLKTVTK*

>peptide 6 (36 aa)
PAPSYPSPLVSAIGSPARRRRRDFLSSRLTEFETKL*

>peptide 7 (407 aa)
MACKKGGIARDYNKKVDRILKKHSGTGMKKFEIEFYGPSNANTYYHLNNWLEIAITSGIEELTLRLTPDVTKYNFPCSLLSDGRGDLIQSLHLSHCSFRP
TVEVVSLRSLTSLDLCLVRITDRELGILLSNSLVLEKLGIKYCDKINCLKIPCVLERLSSLEVFECYSLQMVESKAPNLCSFCFGGEQVQFSIGEPLQMK
NLQVIFPNSISFGRAELPFSMPNLETLNISSRCEMSHTPTAPGKFLHLRYLSITFAGWRFSRAYDYFSLVSFLDASPLLETFILCILQKGKHDLTLRDPI
YPRQMSERQHDSLKNVKINGFSSTKSLVELTCHILQNTTSLECLTLDTTRIEFRCSDSSVDVCLPSDRDAIKGAHKALLAIRTYIEGIVPATVKFSVLEP
CRRCYAW*

>peptide 8 (69 aa)
MVFVSFKANLVTSLFLFFTIDVVIVRGAGIIHPNTKFGILYFNSVRLYEEVGHLDMELTGGGEQWWLRK*

>peptide 9 (59 aa)
MQQKREIFSARPSGGHLAPYTFLTVTSRCCPCCLRVSGFSMFMEVPSPPHLQFANSGLE*

>peptide 10 (31 aa)
MRCAFCFKISGVLVSIKMLRYVLWFIINLFL*

>peptide 11 (167 aa)
LQLLPIRLLWLVPLVAPLGDADAISSPRALLNSKRNCRSYSREREREREREEADADPLISRLDLRYHRIMGLLGLNRLMSIQREQRCRQIEASKPHVGSV
LLLSASCVSPPFFFYVLYNFSNTIKAGCYALYLTERQDSAATSLFFLTKILFLMCLLFFHGFCELQS*

Sequence

>CNT0031500
CTCCAGCTCCTTCCTATCCGTCTCCTTTGGTTAGTGCCATTGGTAGCCCCGCTCGGCGACGCCGACGCGATTTCCTCTCCTCGCGCCTTACTGAATTCGA
AACGAAATTGTAGATCATATAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGCAGACGCGGACCCCTTGATTTCTCGGCTAGATCTGAGATATCA
TCGCATCATGGGACTGCTGGGGTTGAATCGGCTCATGTCCATACAGCGGGAGCAGCGCTGTCGCCAAATCGAAGCCAGTAAGCCGCATGTTGGATCTGTG
CTACTGCTATCTGCATCTTGTGTTTCCCCCCCTTTTTTTTTTTATGTGTTATATAACTTCTCCAATACAATTAAAGCTGGTTGCTACGCTTTATATCTTA
CAGAAAGACAGGACTCAGCCGCCACCAGTCTGTTCTTCCTTACAAAAATCCTCTTCTTGATGTGCTTGCTGTTTTTTCATGGTTTTTGTGAGCTTCAAAG
CTAACCTTGTTACAAGCTTGTTCCTTTTTTTCACGATAGATGTTGTCATAGTTAGAGGAGCTGGGATTATCCACCCAAACACAAAATTTGGCATACTGTA
TTTTAATAGTGTGCGACTATATGAGGAGGTTGGACACTTGGACATGGAACTCACGGGGGGAGGAGAGCAGTGGTGGCTGAGAAAATAGGAATTCCACTTG
CTGTCGGCTGATGAGCTCCACGGTATTAGAGAAAAAGTCACACCGTTTTGCAAAAGAATACCTCTGCTCAATTGGCGGAGTTTTTTTCCCATTAATATAC
TGTAGTAACAAGTTGCAGCTTAAAACAGTTACTAAGTAGGATAATGGATCATTGAATCTGTGTGTATTTCAGTGCTTTGATGCCTTCATCTGTTTGTTTT
CTTCCAATTATATACACAATGTCATAACCATTGTGTGTTGCAGATCGTCTTCTTGCATCCACTGATAAAAGAAAGGGGTCTCCCTGCAAACAAGATAATT
CCCGATGCAGCAAAAGAGAGAGATATTCTCAGCCAGACCTTCCGGAGGACATTTGGCGCCATATACATTCCTTACTGTCACTTCAAGATGCTGCCCGTGC
TGCTTGCGTGTCTCGGGCTTTTCTATGTTTATGGAGGTGCCGTCCCCACCTCACCTTCAGTTTGCAAACTCTGGGCTTGAGTGAAATGGCATGTAAAAAG
GGTGGAATAGCTAGAGATTACAATAAAAAAGTTGACCGCATACTGAAAAAACACTCAGGCACAGGAATGAAGAAATTTGAGATCGAATTCTATGGTCCTT
CAAATGCAAACACCTATTATCATCTCAATAATTGGCTTGAGATTGCTATTACATCTGGAATTGAAGAACTCACCCTTAGGTTGACTCCAGATGTGACAAA
GTACAACTTCCCTTGCTCACTTTTATCTGATGGAAGAGGGGACTTGATTCAGTCTCTTCACCTTTCCCACTGTTCCTTCCGTCCAACAGTTGAGGTTGTT
AGCTTGAGAAGCCTGACAAGTTTAGATCTATGTTTGGTGCGTATTACGGATAGAGAGTTAGGAATTCTCCTTTCCAATTCTTTAGTTTTGGAGAAGTTGG
GAATCAAATACTGCGACAAGATTAATTGCCTGAAGATACCTTGTGTTCTAGAGAGGCTCAGTTCACTGGAAGTGTTTGAATGTTACAGCCTACAAATGGT
AGAGAGCAAAGCTCCAAATTTATGCAGTTTTTGCTTTGGAGGTGAACAGGTACAGTTCTCAATTGGAGAACCGCTGCAAATGAAGAACCTGCAAGTGATC
TTCCCCAACAGTATCAGTTTTGGCCGTGCTGAACTTCCATTTAGTATGCCTAATCTTGAAACTCTTAATATCAGTTCACGTTGTGAGATGTCCCATACAC
CAACTGCACCTGGCAAATTCCTTCACCTCAGATACTTGAGTATTACTTTTGCGGGATGGAGATTTTCACGTGCCTACGATTATTTTTCTCTTGTTTCTTT
TCTTGATGCTTCTCCTTTGTTGGAGACTTTCATCCTATGTATTTTACAGAAAGGAAAGCATGACTTAACTTTAAGGGATCCTATATATCCAAGGCAAATG
TCTGAACGCCAGCATGACAGCCTAAAGAATGTGAAGATCAATGGTTTCAGTTCCACAAAAAGCTTGGTTGAGCTAACATGCCATATTCTTCAGAACACAA
CTTCGCTTGAGTGCCTTACATTGGACACTACTCGCATTGAGTTTCGGTGTTCTGATAGTAGTGTTGATGTATGTCTCCCATCGGACAGGGATGCTATCAA
GGGAGCGCATAAAGCGCTCTTGGCTATCAGAACATATATTGAGGGTATAGTTCCCGCTACAGTCAAGTTCAGTGTTCTAGAGCCTTGCCGCCGTTGCTAC
GCTTGGTAACTATGCCAAATCATTGTAATTAAACAGTATTTAATTGTGTAACTTCAGATGCGTTGTGCTTTCTGTTTTAAAATCAGTGGTGTACTGGTGT
CCATAAAAATGCTGAGGTATGTGCTTTGGTTTATTATTAATCTCTTTCTGTAACTTAAGATGTGTCGTGATTTTGTTCCAAGTTATTGGTGGTCTGTTAT
ATTCAGGACTGTGCTTTGGTTAA