Detailed information on CNT0000052 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FMR1|RGAP1_ARATH, E-value = 1e-13

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0000052

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (67 aa)
MYSRFCKLCLEYQICKIRILILLCGINQIKQYLCLSRNLMEVARSKASVMLISDISNKQAYLTIHTPG

>peptide 2 (30 aa)
MLHRMCFALFADNLRKQPRLNHFGSIYIKF*

>peptide 3 (53 aa)
MMEITSLIFVGFFLFCFSHVYGVSTESMQLSHDTRGNSLPTVLLLMQRHLYTL*

>peptide 4 (100 aa)
MWDFKWRRRWFEWETFLVTTINHMLANVRIQKQGRDSWWWLDDNTGIYSVKYGYRVLHNLLMGSQPTEAFSMIWKLKVPKKVICLVWREYSWIDCQLRTI
*

>peptide 5 (105 aa)
MDASQDVFCAFCGQFEETTPIEPFWQHLHKVLKKEAEMWVVVWCTVIWYVWWVRNKCGFTESVFDRKLVMQNIHAYQVSTFLLLNGCLTWLCVCLLHGMD
NENLR*

Sequence

>CNT0000052
ATTTGTTTTTGCATAAAGATGGTACTTGTCTTTCTCATGATTCATGATGGAAATAACTAGTTTGATTTTTGTTGGCTTCTTTTTGTTTTGTTTTTCACAT
GTTTATGGAGTTTCAACAGAATCCATGCAGTTATCACATGACACAAGAGGGAACAGTTTGCCAACCGTACTGCTTCTAATGCAAAGGCACTTGTACACAC
TTTGAGGGTTTCAGGCAGAGGAGATCTTCAGAATTATTGCACACAATTGTCTAGAGGAGTGTTAGGGATGAATTAAATAGGGGATTTGGTCCCAGAAGAT
ATTGATGTACATTGTTTGGCAGTACTAATTAAGTGTAGGGTTTTTTGGGTGGGAGATACTTGGATGTGGGATTTCAAGTGGAGAAGGAGATGGTTCGAAT
GGGAGACATTTTTGGTTACAACCATAAATCACATGTTAGCAAATGTTAGAATTCAGAAACAGGGTCGTGATAGTTGGTGGTGGCTTGATGACAACACTGG
AATATACTCAGTAAAATATGGGTATAGGGTCTTGCATAATTTACTTATGGGAAGTCAACCAACAGAGGCGTTTTCAATGATTTGGAAATTGAAGGTCCCG
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GTTTTGCGCTTTTTGCGGACAATTTGAGGAAACAACCCCGATTGAACCATTTTGGCAGCATTTACATAAAGTTTTGAAAAAAGAAGCAGAAATGTGGGTG
GTAGTTTGGTGCACAGTTATATGGTACGTTTGGTGGGTAAGAAATAAATGTGGTTTCACGGAATCTGTTTTTGACAGGAAGCTGGTTATGCAGAATATTC
ATGCGTATCAAGTTTCAACTTTTCTTTTGCTCAATGGATGTCTAACCTGGCTTTGTGTATGTCTACTTCATGGGATGGATAATGAAAATCTAAGATGAAT
AGCTGCTGGAGGGGGATAATCGTGTAAAGTCATACTCTTTCCATATCATATTAAAGCTTCAACCTTTTTTGGGTTCTGTGATTTGGATCATCAGGTTCAG
GAAGATTGGAGTAAATTCTGGCACTCATGTGGCTTCTAGGATACGTGGCAGTCTTGGCTTTATCGTAGACTTCTGATCATTGTATTTATGTATTCACGTT
TCTGTAAGTTATGTTTGGAATATCAAATATGTAAAATAAGGATTCTAATCTTACTTTGTGGGATCAACCAAATAAAGCAATATTTATGTTTATCTAGAAA
CTTGATGGAAGTTGCAAGAAGCAAAGCAAGTGTTATGTTAATTTCTGATATTTCAAATAAACAGGCATACCTCACAATTCACACTCCTGGTC