miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
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|
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Strand = Plus / Minus
Query: 9 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattttagcattttccacatttatattgttgtta 68
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Sbjct: 160 tacttcctccgtttcatattataagactttctagcattatcaacattcatatatatgtta 101
Query: 69 ttgaatctagacatatatatttatctagattcattaacatcaatatgaat 118
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Sbjct: 100 atgaatctagacatatatgtatgtctagattcattaatatctatatgaat 51
>42171_osa-MIR819c:mirbase
Length = 154
Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
Identities = 91/110 (82%)
Strand = Plus / Minus
Query: 9 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattttagcattttccacatttatattgttgtta 68
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Sbjct: 154 tacttcctccgtttcatattataaggctttctagcattgcccacattcatatatatgtta 95
Query: 69 ttgaatctagacatatatatttatctagattcattaacatcaatatgaat 118
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Sbjct: 94 atgaatctagacatatatgtgtgcctagattcattaacatctatatgaat 45
Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
Identities = 100/123 (81%)
Strand = Plus / Plus
Query: 40 tagcattttccacatttatattgttgttattgaatctagacatatatatttatctagatt 99
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Sbjct: 32 tagcattgcccacattcatatagatgttaatgaatctaggcacacatatatgtctagatt 91
Query: 100 cattaacatcaatatgaatatagaaaatactagaatgacttacattgtgaaacggaggaa 159
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Sbjct: 92 cattaacatatatatgaatgtgggcaatgctagaaagccttataatatgaaacggaggaa 151
Query: 160 gta 162
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Sbjct: 152 gta 154
>42179_osa-MIR819k:mirbase
Length = 156
Score = 65.9 bits (33), Expect = 9e-12
Identities = 93/113 (82%)
Strand = Plus / Minus
Query: 8 gtactccctccgtttcacaatgtaagtcattttagcattttccacatttatattgttgtt 67
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Sbjct: 156 gtacttcctccgtttcatattataagactttctagcattgtccacattcatatatatatt 97
Query: 68 attgaatctagacatatatatttatctagattcattaacatcaatatgaatat 120
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Sbjct: 96 aatgaatctagacacatatgtgtgtcaagattcattaacatctatatgaatat 44
Score = 56.0 bits (28), Expect = 9e-09
Identities = 82/100 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 64 tgttattgaatctagacatatatatttatctagattcattaacatcaatatgaatataga 123
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Sbjct: 57 tgttaatgaatcttgacacacatatgtgtctagattcattaatatatatatgaatgtgga 116
Query: 124 aaatactagaatgacttacattgtgaaacggaggaagtac 163
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Sbjct: 117 caatgctagaaagtcttataatatgaaacggaggaagtac 156
