miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40947_mtr-MIR2653b:mirbase
          Length = 266

 Score =  527 bits (266), Expect = e-150
 Identities = 266/266 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   cgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   cgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 60

                                                                       
Query: 61  cggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgcca 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgcca 120

                                                                       
Query: 121 agcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttggg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttggg 180

                                                                       
Query: 181 ttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 240

                                     
Query: 241 cgacgtctgtgtgattgtgccagtct 266
           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgacgtctgtgtgattgtgccagtct 266




>40946_mtr-MIR2653a:mirbase
          Length = 266

 Score =  527 bits (266), Expect = e-150
 Identities = 266/266 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   cgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   cgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 60

                                                                       
Query: 61  cggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgcca 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgcca 120

                                                                       
Query: 121 agcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttggg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttggg 180

                                                                       
Query: 181 ttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 240

                                     
Query: 241 cgacgtctgtgtgattgtgccagtct 266
           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgacgtctgtgtgattgtgccagtct 266