miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>28351_hsa-mir-1-2:mirbase
Length = 85
Score = 161 bits (81), Expect = 1e-40
Identities = 84/85 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtaggc 95
||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggtaggc 85
>30036_ppa-mir-1:mirbase
Length = 85
Score = 161 bits (81), Expect = 1e-40
Identities = 84/85 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtaggc 95
||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggtaggc 85
>33120_bta-mir-1-2:mirbase
Length = 85
Score = 161 bits (81), Expect = 1e-40
Identities = 84/85 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtaggc 95
||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggtaggc 85
>27327_mdo-mir-1:mirbase
Length = 86
Score = 159 bits (80), Expect = 5e-40
Identities = 83/84 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtagg 94
||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggtagg 84
>30138_ptr-mir-1-2:mirbase
Length = 84
Score = 159 bits (80), Expect = 5e-40
Identities = 83/84 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtagg 94
||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggtagg 84
>26936_eca-mir-1:mirbase
Length = 78
Score = 147 bits (74), Expect = 2e-36
Identities = 77/78 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 14 tactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaa 73
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaa 60
Query: 74 gaagtacgtatttttggt 91
|||||| |||||||||||
Sbjct: 61 gaagtatgtatttttggt 78
>25880_gga-mir-1a-2:mirbase
Length = 85
Score = 137 bits (69), Expect = 2e-33
Identities = 81/85 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acctgctcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 60
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtaggc 95
||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct: 61 aaagaagtatgtatttttggcaggc 85
>25684_xtr-mir-1a-1:mirbase
Length = 84
Score = 129 bits (65), Expect = 4e-31
Identities = 68/69 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 20 gagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagta 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 gagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagta 69
Query: 80 cgtattttt 88
||||||||
Sbjct: 70 tgtattttt 78
>31416_oan-mir-1a:mirbase
Length = 102
Score = 129 bits (65), Expect = 4e-31
Identities = 80/85 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 acctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgt 70
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 10 acctgctcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacataaaaagctatggaatgt 69
Query: 71 aaagaagtacgtatttttggtaggc 95
||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct: 70 aaagaagtatgtatttttggcaggc 94
>26389_tgu-mir-1-2:mirbase
Length = 72
Score = 125 bits (63), Expect = 7e-30
Identities = 66/67 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 2 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtatgta 61
Query: 84 tttttgg 90
|||||||
Sbjct: 62 tttttgg 68
>31765_mmu-mir-1b:mirbase
Length = 122
Score = 125 bits (63), Expect = 7e-30
Identities = 78/83 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 12 cctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgta 71
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 112 cctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacattcagtgctatggaatgta 53
Query: 72 aagaagtacgtatttttggtagg 94
|||||||| ||||||| ||||||
Sbjct: 52 aagaagtatgtattttgggtagg 30
>31766_mmu-mir-1b:mirbase
Length = 122
Score = 125 bits (63), Expect = 7e-30
Identities = 78/83 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 12 cctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgta 71
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 112 cctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacattcagtgctatggaatgta 53
Query: 72 aagaagtacgtatttttggtagg 94
|||||||| ||||||| ||||||
Sbjct: 52 aagaagtatgtattttgggtagg 30
>32648_rno-mir-1:mirbase
Length = 87
Score = 125 bits (63), Expect = 7e-30
Identities = 78/83 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 12 cctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgta 71
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 3 cctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacatagaatgctatggaatgta 62
Query: 72 aagaagtacgtatttttggtagg 94
||||||| ||||||| ||||||
Sbjct: 63 aagaagtgtgtattttgggtagg 85
>33064_rno-mir-3571:mirbase
Length = 111
Score = 125 bits (63), Expect = 7e-30
Identities = 78/83 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 12 cctactcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgta 71
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 96 cctactcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacatagaatgctatggaatgta 37
Query: 72 aagaagtacgtatttttggtagg 94
||||||| ||||||| ||||||
Sbjct: 36 aagaagtgtgtattttgggtagg 14
>27641_mml-mir-1-2:mirbase
Length = 72
Score = 123 bits (62), Expect = 3e-29
Identities = 68/70 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 18 cagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaag 77
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaaggctatggaatgtaaagaag 60
Query: 78 tacgtatttt 87
|| |||||||
Sbjct: 61 tatgtatttt 70
>26614_cfa-mir-1-2:mirbase
Length = 59
Score = 109 bits (55), Expect = 4e-25
Identities = 55/55 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 25 catacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagta 79
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 catacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagta 55
>31764_mmu-mir-1a-2:mirbase
Length = 72
Score = 109 bits (55), Expect = 4e-25
Identities = 67/71 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 17 tcagagtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaa 76
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tcagagcacatacttctttatgtacccatatgaacattcagtgctatggaatgtaaagaa 60
Query: 77 gtacgtatttt 87
||| |||||||
Sbjct: 61 gtatgtatttt 71
>34185_dre-mir-1-2:mirbase
Length = 87
Score = 85.7 bits (43), Expect = 6e-18
Identities = 65/71 (91%), Gaps = 1/71 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 22 gtacatacttctttatgtacccatatgaacata-caatgctatggaatgtaaagaagtac 80
|||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtacatacttctttatgtgcccatatgaacatataaaagctatggaatgtaaagaagtat 71
Query: 81 gtatttttggt 91
||||| |||||
Sbjct: 72 gtattcttggt 82
>34683_tni-mir-1:mirbase
Length = 92
Score = 85.7 bits (43), Expect = 6e-18
Identities = 65/71 (91%), Gaps = 1/71 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 22 gtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaat-gctatggaatgtaaagaagtac 80
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 15 gtacatacttctttatgtacccatatgaacatatgataactatggaatgtaaagaagtat 74
Query: 81 gtatttttggt 91
||||| |||||
Sbjct: 75 gtattcttggt 85
>34535_fru-mir-1:mirbase
Length = 76
Score = 75.8 bits (38), Expect = 6e-15
Identities = 63/70 (90%), Gaps = 1/70 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 22 gtacatacttctttatgtacccatatgaacatacaat-gctatggaatgtaaagaagtac 80
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 7 gtacatacttctttatgtacccatatggacatatgataactatggaatgtaaagaagtat 66
Query: 81 gtatttttgg 90
||||| ||||
Sbjct: 67 gtattcttgg 76
>31763_mmu-mir-1a-1:mirbase
Length = 77
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-13
Identities = 56/63 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10 acatacttctttatatgcccatatgaacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 69
Query: 84 ttt 86
|||
Sbjct: 70 ttt 72
>33119_bta-mir-1-1:mirbase
Length = 76
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-13
Identities = 56/63 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10 acatacttctttatgtgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 69
Query: 84 ttt 86
|||
Sbjct: 70 ttt 72
>33905_ssc-mir-1:mirbase
Length = 108
Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-13
Identities = 56/63 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 25 acatacttctttatgtgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 84
Query: 84 ttt 86
|||
Sbjct: 85 ttt 87
>26388_tgu-mir-1-1:mirbase
Length = 72
Score = 61.9 bits (31), Expect = 8e-11
Identities = 55/63 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 2 acatacttctttatatgcccatatgaacctggcaagctatggaatgtaaagaagtatgta 61
Query: 84 ttt 86
|||
Sbjct: 62 ttt 64
>26937_eca-mir-1-2:mirbase
Length = 76
Score = 61.9 bits (31), Expect = 8e-11
Identities = 55/63 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10 acatacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 69
Query: 84 ttt 86
|||
Sbjct: 70 ttt 72
>27640_mml-mir-1-1:mirbase
Length = 77
Score = 58.0 bits (29), Expect = 1e-09
Identities = 53/61 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10 acatacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 69
Query: 84 t 84
|
Sbjct: 70 t 70
>28350_hsa-mir-1-1:mirbase
Length = 71
Score = 58.0 bits (29), Expect = 1e-09
Identities = 53/61 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 7 acatacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 66
Query: 84 t 84
|
Sbjct: 67 t 67
>30137_ptr-mir-1-1:mirbase
Length = 70
Score = 58.0 bits (29), Expect = 1e-09
Identities = 53/61 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 6 acatacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 65
Query: 84 t 84
|
Sbjct: 66 t 66
>30742_ppy-mir-1-1:mirbase
Length = 71
Score = 58.0 bits (29), Expect = 1e-09
Identities = 53/61 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 7 acatacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagtatgta 66
Query: 84 t 84
|
Sbjct: 67 t 67
>38847_lgi-mir-1:mirbase
Length = 92
Score = 56.0 bits (28), Expect = 5e-09
Identities = 31/32 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 aatgctatggaatgtaaagaagtacgtatttt 87
|||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 49 aatgctatggaatgtaaagaagtatgtatttt 80
>25879_gga-mir-1a-1:mirbase
Length = 71
Score = 56.0 bits (28), Expect = 5e-09
Identities = 57/64 (89%), Gaps = 2/64 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacata-caatgctatggaatgtaaagaagtacgt 82
|||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 7 acatacttctttatatgcccatatgaacctggcaat-ctatggaatgtaaagaagtatgt 65
Query: 83 attt 86
||||
Sbjct: 66 attt 69
>25829_xtr-mir-206:mirbase
Length = 70
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-08
Identities = 49/55 (89%), Gaps = 1/55 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagt 78
|||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||
Sbjct: 7 acatgcttctttatatacccatatgaac-tacattgttatggaatgtaaggaagt 60
>26613_cfa-mir-1-1:mirbase
Length = 59
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-08
Identities = 48/55 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 25 catacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagta 79
||||||||||||| | |||||||| || | | | |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 catacttctttatatgcccatatggacctgctaagctatggaatgtaaagaagta 55
>25685_xtr-mir-1a-2:mirbase
Length = 71
Score = 52.0 bits (26), Expect = 8e-08
Identities = 29/30 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 caatgctatggaatgtaaagaagtacgtat 84
||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 39 caatgctatggaatgtaaagaagtatgtat 68
>34184_dre-mir-1-1:mirbase
Length = 106
Score = 50.1 bits (25), Expect = 3e-07
Identities = 52/61 (85%)
Strand = Plus / Plus
Query: 24 acatacttctttatgtacccatatgaacatacaatgctatggaatgtaaagaagtacgta 83
|||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 23 acatacttctttatatgcccatatgaacaagagcagctatggaatgtaaagaagtatgta 82
Query: 84 t 84
|
Sbjct: 83 t 83
>25415_pma-mir-1a:mirbase
Length = 85
Score = 46.1 bits (23), Expect = 5e-06
Identities = 23/23 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 60 ctatggaatgtaaagaagtacgt 82
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 50 ctatggaatgtaaagaagtacgt 72
>34806_spu-mir-1:mirbase
Length = 96
Score = 44.1 bits (22), Expect = 2e-05
Identities = 25/26 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 60 ctatggaatgtaaagaagtacgtatt 85
|||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 57 ctatggaatgtaaagaagtatgtatt 82
>25417_pma-mir-1c:mirbase
Length = 92
Score = 42.1 bits (21), Expect = 8e-05
Identities = 21/21 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 59 gctatggaatgtaaagaagta 79
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 53 gctatggaatgtaaagaagta 73
>25654_xla-mir-1b:mirbase
Length = 59
Score = 42.1 bits (21), Expect = 8e-05
Identities = 24/25 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 caatgctatggaatgtaaagaagta 79
|||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 31 caatgctatggaatgttaagaagta 55
>24644_bfl-mir-1:mirbase
Length = 96
Score = 40.1 bits (20), Expect = 3e-04
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 61 tatggaatgtaaagaagtacgtat 84
||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 54 tatggaatgtaaagaagtatgtat 77
>25686_xtr-mir-1b:mirbase
Length = 62
Score = 40.1 bits (20), Expect = 3e-04
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 aatgctatggaatgtaaagaagta 79
||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 35 aatgctatggaatgttaagaagta 58
>35270_aga-mir-1:mirbase
Length = 98
Score = 40.1 bits (20), Expect = 3e-04
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 60 ctatggaatgtaaagaagta 79
||||||||||||||||||||
Sbjct: 59 ctatggaatgtaaagaagta 78
