miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>53521_ptc-miRf11699-akr:pmrd
Length = 146
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 74
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 14
>53510_ptc-miRf11688-akr:pmrd
Length = 146
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 74
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 14
>52635_ptc-miRf10813-akr:pmrd
Length = 134
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 67
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 68 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 127
>52628_ptc-miRf10806-akr:pmrd
Length = 120
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
>52627_ptc-miRf10805-akr:pmrd
Length = 134
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 67
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 68 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 127
>52215_ptc-miRf10393-akr:pmrd
Length = 146
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 74
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 14
>52204_ptc-miRf10382-akr:pmrd
Length = 146
Score = 238 bits (120), Expect = 8e-64
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 tgttgggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatg 74
Query: 61 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gagattggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatcccaaca 14
>52214_ptc-miRf10392-akr:pmrd
Length = 112
Score = 222 bits (112), Expect = 5e-59
Identities = 112/112 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5 gggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatggaga 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 gggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatggaga 53
Query: 65 ttggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatccc 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 ttggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatccc 1
>52203_ptc-miRf10381-akr:pmrd
Length = 112
Score = 222 bits (112), Expect = 5e-59
Identities = 112/112 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5 gggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatggaga 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 gggatacatatcgagacttgcttaatacttgccttcatcatggttttggaaacatggaga 53
Query: 65 ttggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatccc 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 ttggtaagttagcaacattggtaagtattaagcatgtctcgataccaatccc 1
