GGAACACTACTACTACTACTAACTCAAGATTATTAATTCTTTGGTGAGTTATTTTTTGAAAGAGTTTATGGCGATTTTATTGGTCACTTTCGTGTACATATACAATTTAATTTATATTTTTATCTCTTTGGGAT
---------- ACTACTACTAACTCAAGATT 1
------------------------- AGATTATTAATTCTTTGGTGA 3
--------------------------- ATTATTAATTCTTTGGTGAG 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------- TACAATTTAATTTATATTTT  2