ABOUT THIS RECORDspecies: Panax ginseng
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panax ginseng Panax Araliaceae Apiineae Apiales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTTGGGACGGAGGGAGTATA miRNA* CATTTAATCATGTCTCAAATGA mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATGAAACTCAAACAAAGGAGCTTCAAATACCAGGTTTTGGATCATTTAATCATGTCTCAAATGACATCAAATGCGGTAAAGGCGACCGAATTCGATATCA
ATCAGATATTCTCGACTTCAATCAGTTTTGATTTTTTTAAATCAAATTGACTATTTTTAGAATTAACAATTAAGCATATATAAATATATTTTTAAAATTA
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 0.0003 PMRD osa-miRf10302-akr: 0.00008 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.0004 | most similar mature miRNAs |
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