ABOUT THIS RECORDspecies: Phaseolus acutifolius
miRNA family: MIRf1688
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CATTGCTTGTTTGTGTGCTGG miRNA* AGCACAACAGCAAAAATGGA mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
CTAATAATCACCATTGCTTGTTTGTGTGCTGGGGTAACAGAAAAATCAATAATCCCACAAAATTTTGGTGATACTATGAAAATGTAGAAGTAACTATTTA
TCATTTCATCTTCACTATGAAAAATTATTGATTATTTCTTACCAAGAAGTTAATGTAAGAACATCATTGAATATGAACCAAAAGGGATGCAGATTCTTAC
TTGTTTTCTAGCTTTTGTATTTTTCTACTTTCTTCCCATGCTTTGATTAGTGATAACCTCTTCTCAGTCGCAACTCTTGCAAGCACCGCATCTGAAAATA
AATAAGGATGATGACATAATACAAAAGGGTTCATAAATGGAAATTAAATTTCATAATATCACATGACAAACCTCTGTTTACAGAACCCTCAGTTGGTTTT
ACTTCAGCAACTTCTTGAGTCTCTGACAATATAACCAAATTAACAATAATAAACAGCACAACAGCAAAAATGGACAGAAGTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|P93788|REMO_SOLTU: 0.00001 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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