ABOUT THIS RECORDspecies: Pinus banksiana
miRNA family: MIR946
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Pinus banksiana Pinus Pinus Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGACCTTCTCCTATCCACAA miRNA* GTGGATATGGAAGGGTTAGTA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
GGACCTGCTTTCTTGCCATATGAAGAAATTGATGCGTTCAGAGTGTATGGATGTGGATATGGAAGGGTTAGTAAACGGTACAAAACCCACTTAAAGGATA
TTCCGTTAGAGGCATCATTGTTGGCTGCTCGAGATCAAGCAACTGTGTTCAATTTGATGGCCATACTCACTAAATGGGTTTCCTGTTTTCTCTTCACCAG
TCCTTCTCCTATCCAACTCTGTTCAAGCACCTGCATTTTGACGCCCATGGCTCTTCTCCTATCCAGCTGCACCTGTATTTTGACGGCCTTGTTCATTAAA
TGGGTTGGCTGTTTGCTCTTAACTAGACCTTCTCCTATCCACAATTGTACTAGTTTGTTCACACCAATTTCTTCGACGGCAATCTGGAGCGGC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR946b: 1e-25 PMRD pta-miR946b: 1e-25 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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