ABOUT THIS RECORDspecies: Populus nigra
miRNA family: MIRf89
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Populus nigra Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTTGGTAACACCAATTGGGT miRNA* CCAATTGGTGTTACCAACATA mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAAAGAACAGCGGTAAAAATGCAACCACCAAATTGGAAGAAAGGAGCATTATGTTGGTAACACCAATTGGGTAGTTTGCTTCTTTAAAGGACCATTTCTG
CCATCTTGAAGGTGTTTCACGGATTAAAATCAAGAAAGGCACCACCAACACGAAAAATAGGGAAATCTCTCTCCATGACAAATCCCAATCCTTGGTCCTT
TAAAGAAGCAAACTACCCAATTGGTGTTACCAACATAATGCTCCTTTCTTCCTTTTTTGTCATGTTAAAATTACCGAGCTCCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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