ABOUT THIS RECORDspecies: Brachypodium distachyon
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brachypodium distachyon Brachypodium Brachypodieae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCACGTTTATAGAAAAT miRNA* TTTCTATAAATTCGGTCAATA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
CACTGACTTCTAGGTTTGACCTAAGTCAAACGTTTTAAATTTTGACCACGTTTATAGAAAATGTATTAATATTAATATGTACTTCCTCCGTACTATAATT
CTTGTCTAAAATTTGCCCAAATATGGATATATCTATTCCTAAAAAGCGTCTAGGTACATGTAATATTTCGACAAGAATTATGAAACGGAGGGAATATATT
AATAAGTATGCTATGAAAATATATATGCCATGCTTGTTTTGATAAAACTAATTTGAAGTTGTAAATGTTAGTAAACTTTTCTATAAATTCGGTCAATATT
TGAAGAGTTTGACACAGGACAGACCTAGAACATCTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR1135: 0.000000000000005 PMRD bdi-miR1135: 0.000000000000005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 2e-33 | most similar mature miRNAs |
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