ABOUT THIS RECORDspecies: Cycas rumphii
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Cycas rumphii Cycas Cycadaceae Cycadales Cycadopsida Cycadophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGTTTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAATCA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TATGTGAGAATAAGGAGATTGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATCAAGGCTTGCGCAAGGTCGGTTCAGCTGCTGATTTATGCATTCCGCTGCCCTGATCGC
GTCCTCGGATTCCAGAGTTGCATGGCAGGGCTAGCGGTGTGCATGACGCAGGAGCTGTATTGACCGTGTGCTTCCCTTTTTTGGTTTGAAGGGAGCTCTA
CAGGAGTCTTTTATTCGTTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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GTCCTCGGATTCCAGAGTTGCATGGCAGGGCTAGCGGTGTGCATGACGCAGGAGCTGTATTGACCGTGTGCTTCCCTTTTTTGGTTTGAAGGGAGCTCTA
CAGGAGTCTTTTATTCGTTT
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR159: 0.0002 PMRD psi-miR159: 0.00001 microPC miR319: 0.00001 | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.0002 | most similar mature miRNAs |
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