ABOUT THIS RECORDspecies: Fragaria vesca
miRNA family: MIR167
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Fragaria vesca Fragaria Potentilleae Rosodae Rosoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAAGCTGCCAGCATGATCTG miRNA* GGTCATTCTTGCAGCTTCAAA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGTTTGTTTGGTTTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTACCACTAGAGACTAAACCTAGCTAGCTTGCTGTATAAATAGATCCGGAGAAGGTTG
AGTGTTGATTTTGTGTTTATGCCATGTATGTCCGTTTTGAGGTTTAGATATAAGAACTGCATCAAATAGATCGGTAAAAGATGCAGCTTGATATAGAAAT
AGGTATTCGAAATTTAGAATAGGATCCGGTTGGTGTTGATTTTGTGCTAGCTTATGTCCGGTGGCTTCAGGTTTAGATATAAGCTAGAACGGCGAAGAGA
TCGAATAGCAGAAGATCTAGATTTATGTAATTTGGTCCATACTTTTGATGGGGGTATTTTAGTTTTTGATAGATCTTGGTTTGTTTCATGTTCTGGGAAT
TCTGGAGAAATGGTTTTGAAGTCCACGAGTTCAGTTAAAGTTAAGTCTTAGATAAGTATATAAGGTTACTCTAGCTATACCAGGTCATTCTTGCAGCTTC
AAACACTCACTCACCAACAGT
dot-bracket secondary structure
...(((((.(((.((((...((((((((((.((.(((((((((((...((((((....(((((.....(((((((((((........((((......(((
(.(((...(((((((((((.(((.((.((....))..)).))).)))))))))))...))))))).....))))......))))))).(((.(((((...
((((..((((((.((((((((...((((...(((((...((((((.((((((((((((....((((...))))..))))))))))))....)))))).((
((((((.(((.(((.......))).))).)))))))).))))).....))))..)))))))).))))))...))))...))))).)))...(((((((..
.((..((...(((.((((.......)))).))).))..)).....))))))).)))).....))))).))))))...))))))))))).)).))))))))
))...))))...)))))))).
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
GGTTTGTTTGGTTTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTACCACTAGAGACTAAACCTAGCTAGCTTGCTGTATAAATAGATCCGGAGAAGGTTG
AGTGTTGATTTTGTGTTTATGCCATGTATGTCCGTTTTGAGGTTTAGATATAAGAACTGCATCAAATAGATCGGTAAAAGATGCAGCTTGATATAGAAAT
AGGTATTCGAAATTTAGAATAGGATCCGGTTGGTGTTGATTTTGTGCTAGCTTATGTCCGGTGGCTTCAGGTTTAGATATAAGCTAGAACGGCGAAGAGA
TCGAATAGCAGAAGATCTAGATTTATGTAATTTGGTCCATACTTTTGATGGGGGTATTTTAGTTTTTGATAGATCTTGGTTTGTTTCATGTTCTGGGAAT
TCTGGAGAAATGGTTTTGAAGTCCACGAGTTCAGTTAAAGTTAAGTCTTAGATAAGTATATAAGGTTACTCTAGCTATACCAGGTCATTCTTGCAGCTTC
AAACACTCACTCACCAACAGT
dot-bracket secondary structure
...(((((.(((.((((...((((((((((.((.(((((((((((...((((((....(((((.....(((((((((((........((((......(((
(.(((...(((((((((((.(((.((.((....))..)).))).)))))))))))...))))))).....))))......))))))).(((.(((((...
((((..((((((.((((((((...((((...(((((...((((((.((((((((((((....((((...))))..))))))))))))....)))))).((
((((((.(((.(((.......))).))).)))))))).))))).....))))..)))))))).))))))...))))...))))).)))...(((((((..
.((..((...(((.((((.......)))).))).))..)).....))))))).)))).....))))).))))))...))))))))))).)).))))))))
))...))))...)))))))).
SIMILARITIES| miRBase zma-MIR167i: 0.0000000005 PMRD zma-miR167i: 0.0000000005 microPC miR167: 0.00003 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 0.0000000005 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
