ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIR166
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGGACCAGGCTTCATTCCTC miRNA* GGGATGTTGTTTGGCTCGACA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAA
TAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR166m: 0.000000009 PMRD zma-miR166m: 0.000000009 microPC miR166: 0.0001 | UniProt no hits RFAM mir-166: 0.0000002 | most similar mature miRNAs |
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