ABOUT THIS RECORDspecies: Chlamydomonas reinhardtii
miRNA family: MIRf1575
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGCCATGCCTGTCTAGCTAT miRNA* AGCAGACAATGTGGCGACA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
GGGCCCCCCCCTAGCAGACAATGTGGCGACAGGAAAGCATAGTGCTTGGGCCTCTTCTATGCCCTTGGCACCCAGATGCAGGTGGATGCACTAGCGCCCA
CGACTAGCGCCCCGTGGACCGTATTGCAGGTCGCAACCTACCCCTGTGGCCTACCCCTCCCTCGTGAATTTACCGTTGATACGCCGCTTTATACTACCAT
GGCCGTAGCACGGGGAACAACCCGCATCATCCGTGACACGTGTATGTACATACCTGCCTTGTTACGTCAGGCTCTTCGTCTTATCACAAAGATTACTGTA
GTCGCTCACGCACCTTCGAAACATTGAACACTGCACAGACGTCTATCTTATTGTCAGCACCACCAAGCACGCTGTATGCAGTATTCTTCATGCAACCTGC
ATGCGCCTTGTTGTGCAGCTCCGATTGCTGGGGGGTTCGCACCGCTGTGCCTGTACGTACAGGCGTACAGCCACACGGGTCCCGAACTCCCTACGTTGCC
TAGCGCATAAGACGCCTTATACCTGTATGGCGTCCTACCAAGTGACAAGGTCACCCGCCTGGCTGCGTGGCCTGCTGGTGGGATCCAGGCGATGTCTCCA
CAATGCCATGCCTGTCTAGCTATGGGTTGTGC
dot-bracket secondary structure
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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