ABOUT THIS RECORDspecies: Helianthus petiolaris
miRNA family: MIR169
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Helianthus petiolaris Helianthus Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CAGCCAAGGATGACTTGCCGG miRNA* GGCAAGTTTTACTTGGCTACG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTGATACATTCATCCATGTTCTTGCATGCGAATACAAGGTATGCATAGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGTGTACTCATAAATCTATTTTTGGATTCG
TTTTTTTTCTTAAAACCTAAAACACTGCACTCAAAAGGTGATCACCAATAACGCATCCGCTAAATATTAGTTTGTAAACAAACGTTATACAACCATTTCA
AGGGTATTTCGACTGACTTTAGTCATGTTTTCATCCAATTAAAAGTAAATGTAACTTTAATTTATCGGCAAGTTTTACTTGGCTACGATATCTATCTGGT
ACTCACATGCTAGAACTATGGTGAGTTTGAGGAAG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tcc-MIR169l: 0.0000003 PMRD vvi-miR169k: 0.000001 microPC miR169: 0.00007 | UniProt no hits RFAM MIR169_2: 0.00000008 | most similar mature miRNAs |
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