ABOUT THIS RECORDspecies: Arachis duranensis
miRNA family: MIR482
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arachis duranensis Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTTCCCAATTCCACCCATTC miRNA* GTGGGTTGGTTGGGAAGAAA mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
CAAGAATTGAGGGAGGTGGGAATGGGAGATTGGAGCTAGCAGAAGTTGTAGGAGTGGGTTGGTTGGGAAGAAATCAAAACCTTATGATATTGTATATGTT
ATGGTTTTTATTTTTTCCCAATTCCACCCATTCCTATTATTTCTATTGGTTCCTCCCTTTCCTTTCTTCTCTACATCACATCT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase mtr-MIR2118: 0.0000001 PMRD mtr-miR2118: 0.000009 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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