ABOUT THIS RECORDspecies: Arachis hypogaea
miRNA family: MIR3514
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arachis hypogaea Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCACCGTTAATACAGAATCCTT miRNA* GGATTCTGTATAACGGTTGACA mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
ACTGTGATTCCTTTGATTAGATACAATAGAAGGATTCTGTATAACGGTTGACATGAGTTTATCTCGTTTTTAAAGATATCTTTGCATTTCATATGAGATT
TAAAGTTTTTATTGGTAATATAAATCTCACATGAAATTTAAATTTATATTTTAAAGTTAAGATAAAGTCATGTCACCGTTAATACAGAATCCTTCAATTA
TATTTAGTCAGGGGAGCTCTTT
dot-bracket secondary structure
.......((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((...(((((((((((..((((.(((((((.(((((((
((..................))))))))).))))))).))))..))).))))))))...))))))).))))))))))))).)))))))))))))).))).
))))))))))))))))......
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
ACTGTGATTCCTTTGATTAGATACAATAGAAGGATTCTGTATAACGGTTGACATGAGTTTATCTCGTTTTTAAAGATATCTTTGCATTTCATATGAGATT
TAAAGTTTTTATTGGTAATATAAATCTCACATGAAATTTAAATTTATATTTTAAAGTTAAGATAAAGTCATGTCACCGTTAATACAGAATCCTTCAATTA
TATTTAGTCAGGGGAGCTCTTT
dot-bracket secondary structure
.......((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((...(((((((((((..((((.(((((((.(((((((
((..................))))))))).))))))).))))..))).))))))))...))))))).))))))))))))).)))))))))))))).))).
))))))))))))))))......
SIMILARITIES| miRBase ahy-MIR3514: 4e-95 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
