ABOUT THIS RECORDspecies: Arachis hypogaea
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arachis hypogaea Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAACAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTGGATGTGGAAGGTGGTGATGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGGTCTTGGTGGGTGGATTGAGCTGCTAAGCTATGGATCCCACAGTACTAC
CCATATATACCCCATTATGCAGTGGTAGTTCTGCGGATTCCATATCCTGGGAGCTTCATTACCTTTCCACAGATCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
CATAGCATCCTCTTTCTAATTAAC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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CCATATATACCCCATTATGCAGTGGTAGTTCTGCGGATTCCATATCCTGGGAGCTTCATTACCTTTCCACAGATCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
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SIMILARITIES| miRBase ahy-MIR159: 4e-107 PMRD pvu-miR159: 6e-23 microPC miR159: 2e-96 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-21 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045397) |
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