ABOUT THIS RECORDspecies: Arachis ipaensis
miRNA family: MIR3514
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arachis ipaensis Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCACCGTTAATACAGAATCCTT miRNA* GGATTCTGTATAACGGTTGACA mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
ACTGTGATTCCTTTGATTAGATACAATAGAAGGATTCTGTATAACGGTTGACATGAGTTTATCTCGTTTTTAAAGATATCTTTGCATTTCATATGAGATT
TAAAGTTTTTATTGGTAATATAAATCTCACATGAAATTTAAATTTATATTTTAAAGTTAAGATAAAGTCATGTCACCGTTAATACAGAATCCTTCAATTA
TATTTAGTCAGGGGAGCTCTTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ahy-MIR3514: 4e-95 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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