ABOUT THIS RECORDspecies: Beta vulgaris
miRNA family: miR3704
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Beta vulgaris Beta Amaranthaceae Caryophyllales core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGTATAGGTGGAGTTGGAAGT miRNA* TTTCTCCTCAGTCTTGTGCTTT mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTGCAATCGTTGGTATAGGTGGAGTTGGAAGTGTTGCGGCTGAAATGCTCACTAAATGTGGCATAAGTCGGCTTTTGCTTTATGATTATGACACAGTAGA
ATTGGCTTACATGAATAGGCTCTTTTTTCGTCCGAGCAAGTTGGTATGACAAAGACTGATGCTGCTGTCCAGACTCTATCAAATATAAATCTGGAGTTGG
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AAGAATCTTTTGAACCTTTTATTAAGTTATTTCAATCATTGCTTTGTTTTCCTCAATACTTAAGGGTGTTTCCAATATCTTTATTAAGTCCTCATTTTCT
CCTCAGTCTTGTGCTTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q6K6K7|UBA5_ORYSJ: 0.000000000000002 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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