ABOUT THIS RECORDspecies: Botryococcus braunii
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Botryococcus braunii Botryococcus Botryococcaceae Trebouxiophyceae incertae sedis Trebouxiophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCTGAT miRNA* TTGATGATGGTGATCATGATG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAAATCATCATCATCATCATCTGATGAGTAGCACGAGAGCTAATTGCCAGCAAACTGCTGTGTCCCAAGCCGAGTTGACATTACACTAGTGGGTGGTACA
GACAGTACTGGACCACTGCAAATGTCCTGGCAGTGCGAGTGGTGCCTCCTCTGCAATGGTACAAGATGCTGTGTTGACATCCACAATGCAAAATGTGTAA
CGGGTGTCAGGCCTTATACACGACACGTTTATGTAACAATGAGCAACTACGCAGTGCATGCGCTCAACTTGTTTTGAACACGTACAGGTGTCTGGGCAGG
GTAAAAGAAGAGGGCGTTGTGCGGTGCAGAATACGTAGACTCATGTACCATAATTTGATGATGGTGATCATGATGC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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TAAATCATCATCATCATCATCTGATGAGTAGCACGAGAGCTAATTGCCAGCAAACTGCTGTGTCCCAAGCCGAGTTGACATTACACTAGTGGGTGGTACA
GACAGTACTGGACCACTGCAAATGTCCTGGCAGTGCGAGTGGTGCCTCCTCTGCAATGGTACAAGATGCTGTGTTGACATCCACAATGCAAAATGTGTAA
CGGGTGTCAGGCCTTATACACGACACGTTTATGTAACAATGAGCAACTACGCAGTGCATGCGCTCAACTTGTTTTGAACACGTACAGGTGTCTGGGCAGG
GTAAAAGAAGAGGGCGTTGTGCGGTGCAGAATACGTAGACTCATGTACCATAATTTGATGATGGTGATCATGATGC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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