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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000239
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR2123
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TAAAAAGTTAACGGTGTCAAA

miRNA*
 TAACGCTGTTAACTTTTTTTA

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 TCATAATACGGGAATTGAATACTCCATCCGTTTCTAAATATTTAACGCTGTTAACTTTTTTTAAATATGTTTGACAGTTCATCTTATTAAAAAAATTTAA
GTAATTATTAATTCTTTTCATATCATTTGATTCATTGAAAAAATACTTAAATGTATACATATAGTTTTACATATTTCACCAAAGTTTTTGAATAAGACGA
ATGTCAAACATGTGGCTAAAAAGTTAACGGTGTCAAATATTTAGAAACAGAGGGAGTATATAGCTCTCTTGCATAA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806h: 9e-44

PMRD osa-miR806h: 9e-44

microPC miR806: 3e-22		UniProt no hits

RFAM MIR806: 3e-53		most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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