ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica rapa
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica rapa Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CAAGTCAGAGAAGTTTGATGA miRNA* GTTTAATTTCATTGATTTTTG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGAAACCTAAGCAGATCGAAATTACGCTTGGCAAGTCAGAGAAGTTTGATGAGCTAATGGCTGCAGCCAATGAAGAAAAGGAAGCAGCAGAAGCTCAGGT
GCAGAGCTGAACACAGCTTTCTACTGTTATGGTTTCATGAATCTTTCTTCTCTCGTGATGCTTTATATTATTTGTTTAATTTCATTGATTTTTGGCTGAA
TTTTGAGTTGTTATGTTGGGAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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AGAAACCTAAGCAGATCGAAATTACGCTTGGCAAGTCAGAGAAGTTTGATGAGCTAATGGCTGCAGCCAATGAAGAAAAGGAAGCAGCAGAAGCTCAGGT
GCAGAGCTGAACACAGCTTTCTACTGTTATGGTTTCATGAATCTTTCTTCTCTCGTGATGCTTTATATTATTTGTTTAATTTCATTGATTTTTGGCTGAA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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