ABOUT THIS RECORDspecies: Festuca arundinacea
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Festuca arundinacea Festuca Loliinae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGTCGTCATCATCATCATCC miRNA* GTGGTGGTGGTGGCGGCATGC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAATATCGTCGTCGTCGTCATCATCATCATCCCCGTAATCCATAAGCTTCAGCAGAGTATCAGAAACTGATGCACTACTTGGTTTTTCTTCTTTAGTCTC
CTTTGAAGAAGGTAATTGAGCTGACAAAACCTTTGGTGGCGAGACAGAGCTCGCGCCCAAGGACTTCAGAGGCACCATAGGCTCCTTTAAATCTGATGAA
TACCTATTTTCATTTCGTAACACTTCAATTGACGGGAACTTGGGTGGTGGTGGAGGCATGTTCCTGGGAGGTGGGGGTGGCATGTCCTTCGAATAAGGTG
GTGACAAGTTCTTGGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCATGCTAGTGGAT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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TAATATCGTCGTCGTCGTCATCATCATCATCCCCGTAATCCATAAGCTTCAGCAGAGTATCAGAAACTGATGCACTACTTGGTTTTTCTTCTTTAGTCTC
CTTTGAAGAAGGTAATTGAGCTGACAAAACCTTTGGTGGCGAGACAGAGCTCGCGCCCAAGGACTTCAGAGGCACCATAGGCTCCTTTAAATCTGATGAA
TACCTATTTTCATTTCGTAACACTTCAATTGACGGGAACTTGGGTGGTGGTGGAGGCATGTTCCTGGGAGGTGGGGGTGGCATGTCCTTCGAATAAGGTG
GTGACAAGTTCTTGGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCATGCTAGTGGAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM mir-598: 0.000001 | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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