ABOUT THIS RECORDspecies: Festuca pratensis
miRNA family: MIR535
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Festuca pratensis Festuca Loliinae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAATGAGAGAGAGAACGG miRNA* TCTCTCCCTCTTGTTTCT mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
AACACTCCTGTATCTCTCCCTCTTGTTTCTCTTCCTCCCCCGTTGCTTCTAATCCTTCCTCTTGCTGCTACTGGATATTAAAATTACTGGTAGGGATCTC
TTGAGGATAATCTTGTGGTGTTAATCAAGGTTCCTATCAGGTGGCAGCTTTTTCTTAGATCGGGGGAGATCATGGATGGGGTGCGCGGTTGCTGGCTTAG
AGTGTCAACTGCTGGGGAAGGGATGCGTGCTTGTCGGCGGGTGTCTGAGAGCTACCCTCAATCACCAATAAAGTACACACAGCTGGCCTGAGCAAGCATG
GCGAAGCATGGAAACGGCACCTATATCCTAGGCCACCTTCGTCTCGCTACCTACAAAAGCACTGAACGCCTCCTCTTCCAGATTAGCAATTAGTGGAGTG
CTATCAGAAATAACCAAGCTCAGCAAAGAACTGGCAGGAATCAAGTACATACAATAGACATGGGCTTGAAAGAGATGCACCAAGTAGTACCGAAGGTAAT
CAATTGAAAAATAATGACAATGAGAGAGAGAACGGCAGGAACCT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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