ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare subsp. spontaneum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare subsp. spontaneum Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCCGTTCCTAAATATAAGTC miRNA* CATATATTTAGGAACGGAGG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTTAGGAGGTTCCACTAGNATATATATATAGACATACTTTACAGTGTAGATTCATTCATTTTGCTTCGTATGTAC
TCCCTCTGTTCCTAAATATAAGTCCTTTAAAGATTCCACCAGGGNACTACATACGGAGCAAAATGAGTCAATCTACACTCTAAAGTATATCTTTGTACAT
CCGTATGTAGTTTGTAGTGTAATGTCTAAAAAGACATATATTTAGGAACGGAGG
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 3e-28 PMRD tae-miR1122: 3e-28 microPC miR1436: 1e-21 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 1e-30 | most similar mature miRNAs |
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