ABOUT THIS RECORDspecies: Liriodendron tulipifera
miRNA family: miR3630
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Liriodendron tulipifera Liriodendron Magnoliaceae Magnoliales magnoliids Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTTGGGAATCTCTCTGATGCA miRNA* CTTTGGATGATATTTCCAAGCC mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GGTGACTTGGTCTTGGGAATCTCTCTGATGCAATATCCTACACAAAACAACCGAAAAAAAAAAGAAGAGCAGAAAAGAGCTTAGTGATGCAAAGTTCTCA
TCTTCAAATCCTTTGTTTCACTGTGGATGGATTTTTGAATCTTAATTTCTTGTTTTGTTTAGACTTTGGATGATATTTCCAAGCCGTTGCTTG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR3630: 0.0006 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM snoR44_J54: 0.000003 | most similar mature miRNAs |
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