ABOUT THIS RECORDspecies: Lolium perenne
miRNA family: MIR172
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Lolium perenne Lolium Loliinae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAATCCTGATGGTGCTGCTG miRNA* GCATTATATTTCAGGTTTAAT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
AGAAGGTGGAATCCCCTAGAGTGAATCCTGATGGTGCTGCTGTACAGGGATCATCAAAAGTAGCTGAAAAACATGTAAACGGAGTCAACGCTAGCTCAGC
AGCTGTTGCTTTGGAGACACCTGATGAAGAAACAATTTCTACGAAAGTTGGTTCTCTTACAATCAGTGGCAAGGCAAGGAAGGCTGACGATGAGAGTCGC
TTGGTTGATGTTGTGACCATTGGCTCGTTGCCAATCCGTGTCAGCAAATCTGTTGAGTAGTAGGCAGTTTTCCTTTTGGGTTGGTAGTCTCTTTCTGGTC
CGGCTTTAAGCATTATATTTCAGGTTTAATGGGGTGATGAATAGAAGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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