ABOUT THIS RECORDspecies: Mesostigma viride
miRNA family: MIRf759
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Mesostigma viride Mesostigma Mesostigmataceae Mesostigmatales Mesostigmatophyceae Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCGATTTTGCTGACGTGGCAT miRNA* GTCACGTTTCGGTATCATCGGGT mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
GCCAGCGGCGTGTGTCACGTTTCGGTATCATCGGGTGCAGAACATTCTAGATCTGATGCGTCCCAGCTGGCCGTGAATGGAACAGCTCGTGAGGGTGTTG
GAGGTTCTACACTGGCAGCTGGCCGGGCGCGGTATAACGCCGGTGCTATTGAAACTCACGTCTCGGGAACTAATGGTACAAATACGTTAAGCCGGCCAGC
TGCGCGTGGACGTATCATCGGTCGGCTGCCTAATTCGCCTAGGCCTGGAACCTTCGAGATCAATGCAGCAGACGCTTATGTGGATGGCGTCGCTGTAACC
GATTTTGCTGACGTGGCATCATCAGTGTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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GCCAGCGGCGTGTGTCACGTTTCGGTATCATCGGGTGCAGAACATTCTAGATCTGATGCGTCCCAGCTGGCCGTGAATGGAACAGCTCGTGAGGGTGTTG
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TGCGCGTGGACGTATCATCGGTCGGCTGCCTAATTCGCCTAGGCCTGGAACCTTCGAGATCAATGCAGCAGACGCTTATGTGGATGGCGTCGCTGTAACC
GATTTTGCTGACGTGGCATCATCAGTGTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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