ABOUT THIS RECORDspecies: Nicotiana benthamiana
miRNA family: MIR1025
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Nicotiana benthamiana Nicotiana Nicotianeae Nicotianoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCCACAACAAAGCTAAGAGA miRNA* TCTCGGCTTTATGCAGCACT mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTCACATACATTTTCTACACTCTCTCGGCTTTATGCAGCACTGCATAAGCAGAAAGCTAATTCGTCAATGTTTACGAGCAAAAAATTGTTGGATTAGTTT
CTTCCTCGAGAAAAAGAAAAACCAATTCCTGCAGGAAGTAATACGTATAGCCAATTAAATGTGCTTATGATGTATTATGCTTCTCCTTCATAGCTAAAGC
AGCAGCTCTGTACCACGCAGCTGCAGCCATGGCACCAGGGTCAGGAATTGAAGCAAGAACATCTCCAGGTATGCAGGTTGAACGGCCAGCCTGCGCTTGC
ATGTGCTTGGTTGGCTCGGCTCCAGCGACTGCTGCCTCAGCAGAAATAACGAAAGCATCCACAGGGTTGTCCCCAGCACTCAACCTCTGTTCCCAATGCA
TAAAAATCGGATAACTCCCTAGCTATCTTCCGTGCGGCCTTAGTCACAATCCGCCCCTGCGATGTGCTAAGTCAGCCTTTCCCCGAAATATTGCCACAAC
AAAGCTAAGAGAAGTAAAGAGAAGCTAAGAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|O04059|DHBK_SOLLC: 8e-20 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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