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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001632
species: Nicotiana tabacum
miRNA family: MIR168
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Nicotiana tabacum Nicotiana Nicotianeae Nicotianoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA

miRNA*
 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 TCCATTTGTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGACTCACCGGTGACGCTGTCCGCGCCGGAATCGGTGGCGTTAGTTTCGTTGA
TATTTTGTTTGTATTTATCGATATTTAGAGAGCTCTCTTTAGGACTTATTTGTTAGTAATTTGTTTTGTTGAAATTAACTTGATGTATGTGTAGATAAGT
AGAGAGTGTTTACCCCCGGTTGGTTAAGTAATAGATATGAAGAGAGTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTAATAAATTAGTTATGTATGAAAGTGCGCCTCGT
CTATGGCTTATGTTTGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGTGACCGCGGTGAATTTGAT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase crt-MIR168: 0.000000000000005

PMRD rco-miR168: 0.000000000000005

microPC miR168: 0.000001		UniProt no hits

RFAM MIR168: 0.0000000000001		most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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