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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001684
species: Panax ginseng
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Panax ginseng Panax Araliaceae Apiineae Apiales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATTTGGGACGGAGGGAGTATA

miRNA*
CATTTAATCATGTCTCAAATGA

mismatches: 5
bulges: 1

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pre-miRNA
ATGAAACTCAAACAAAGGAGCTTCAAATACCAGGTTTTGGATCATTTAATCATGTCTCAAATGACATCAAATGCGGTAAAGGCGACCGAATTCGATATCA
ATCAGATATTCTCGACTTCAATCAGTTTTGATTTTTTTAAATCAAATTGACTATTTTTAGAATTAACAATTAAGCATATATAAATATATTTTTAAAATTA
TAAAAATTGGGATTAGTAATAAATTGTATATATTTTCTTTTGGTTATAATCTCTTCACATATATTTTAGCTAAAATAATAAAAAGATTAGTTTTAAAAAT
GGTCAATTTGACTTTAAAAAGTCAAAACTAAGCAATTAATTTGGGACGGAGGGAGTATAATTTATATATATATTATGTATAGATGTCGGAATTCATAA


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase tae-MIR1122: 0.0003

PMRD osa-miRf10302-akr: 0.00008

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.0004
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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