ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: miR319c
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAGCTCTCTTCAGTCCACTCT miRNA* GTTGGACTGAAGGGTGCTCCC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCTCTGGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTGAAATGGCCGTAGGGTTTCATTAGCTGCCGACTCATCCATTCACCTACCAAGATCCATGGACGCGGAA
TGTCTTGGTAGCTGATTGGATGGCGCGGGAGCTAAAATTAAGCTCTACGCTGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTTGCTCGT
dot-bracket secondary structure
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TCTCTGGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTGAAATGGCCGTAGGGTTTCATTAGCTGCCGACTCATCCATTCACCTACCAAGATCCATGGACGCGGAA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR319a: 5e-69 PMRD zma-miR319a: 5e-69 microPC miR319: 0.0000000006 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-56 | most similar mature miRNAs |
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