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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001789
species: Panicum virgatum
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATTTAGAACGGAGTGAGTATT

miRNA*
 TACTCCCTCCGTTCCAAATTA

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 GTGAACTCCCGGAACTGTAATTTTTACCGAGGTACTCCCTCCGTTCCAAATTATAAGTCACTCCAAGAATCTTGGAGAGTCAAAATTTTTCAAGTTTGAC
CAAATTTATATGATAAGCTAATAACATTTATGATACCAATTAAGTATTATTAGATTCTTTGTTAGCTATATTTTCATAGTGCACCTATTTGATGTCACAA
ATCTTTATATTTTTGTCTATAATTTTGGTCAAATTTTAAGATGGTTTGACTCTTTAAAATTCCTAGAATGACTTTAATTTAGAACGGAGTGAGTATTAGA
AAGCAGTGCAGGGCGCGCTCGCTCGG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD osa-miRf11316-akr: 0.0003

microPC miR1439: 0.0003		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.00000000009		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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