ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTACTCCCTTCGTCTCAAAAT miRNA* TTTAGAACGGAGGGAGTACGT mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
GCCCCTCGGATGTACTCCCTTCGTCTCAAAATAAATACAACTCTATGACTAAACACACAAATTAATTAGACACGCAAATCAATACATATAAAATTACTAA
AATACTTTTTTATTTTTTATAAAAAGAGTGTTTTATCTCTTTTGTAAAAAAACTACGGAAACTTTTATTTATTATAATAGTTGGATCAAAGTAGTATTTT
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf11705-akr: 0.0002 microPC miR1439: 0.0002 | UniProt no hits RFAM MIR806: 0.00006 | most similar mature miRNAs |
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