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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001914
species: Phaseolus acutifolius
miRNA family: MIRf385
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GTTCAGGTTCGGGTTCGGGTT

miRNA*
CCCGAACCCGAACCTGAACCC

mismatches: 0
bulges: 0

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pre-miRNA
GAAGCGCGACGCCGAGTTCCGTCTCGAGCGTCTCCGCACCGCTCGAGGTTTAGAACCGAAGCTTCCCCCTACCGAACCCGAACCCGAACCTGAACCCAAA
CTCGAGCCCGAGCCTTCTTCCGACGCTGGCCACATCAACCCCATCTCAGACTCTAAACTACAATAAACTTCAGATATTGTATGGTAATGATGGGGAAACT
CTTGAAGCAAAACAGAAAAAGAAAACCCAGAATATTATGTTCATCTGGAGACCCTCCTCCTACTGCCAAAAACATCTCTGTGACTCTGCATCTTCTCGTG
TCTCAAAGCCCTCTCCCGGTCCTTCTCTCTTCTTTCCCTYTTCATTCTCTCTTCCCTCAATTCCTCCATCGTCTTCCTCTTCTTCTCACCCTTATTCTCT
CTCCTATCGCCGTCACCACTTTCATCCTTCACAACATCATCATCATTAGGTTTCCGAAGATACCACGGCAACTTAACCCCCTTTCCTGCAAGCCCGTAAC
CAAGCCTATACTTCTCATCCTCCGGGCCCACAACAACGGCGGGCTTGGGCCCTCCCTCCTCCCTTTTCTTCTTCTTGGCAGGGGGACCCTCTTTCTGAGG
CCCCTGAATTGGGTCAAAAATCTTGATCCCTTCGAAGAGGTTGATGTGGCCAGCGTCGGAAGAAGGCTCGGGCTCGAGTTTGGGTTCAGGTTCGGGTTCG
GGTT
CGGTAGGGGGAAGCTTCGGTTCTAAACCTCGAGCGGTGCGGAGACGCTCGAGACGGAACTCGGCGTCGCGCTT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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