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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST002045
species:
Pinus taeda
miRNA family:
MIR952
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Pinus taeda
Pinus
Pinus
Pinaceae
Coniferales
Coniferopsida
Coniferophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
AACAGAGCATGCCGTTGGTT
miRNA*
CCAATGACACGCTCAGTTCA
mismatches:
4
bulges:
0
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pre-miRNA
GCTATCTAAGGAGAGAACCAGTAGCGTATTG
AACAGAGCATGCCGTTGGTT
GAGTAAGTACGTCAAGGGACGAAACAGAATTAATTTTCATTAACATTTT
ATTAACCTTCAACTCTGCCTTGGCCTAGGGCAGTTCCTGAAGGTCACATTGACTGGGGCGTGATACAACGCGTAGTCCGCTGGTTGCTGCGACCATTGGG
ACTCCCCCAGCCTATTCTCATCTGCAACATTCGCAAGTTATTTACAGTGTTGCAGCCGAGAATAAAATGGGAAGAGTCAAAAGCGTGGCAACAACCAGCC
AATTACGCTTTGTATCAGCGCCCCAACTGGTGTGAGCTTCGGGAATTGCCATATGCCAAGCCAGATTTGCATGCTAATAAAACATTATTCGAAATTAATT
GCGTTTTGTTGGTTGACAGACTTCCTCCA
CCAATGACACGCTCAGTTCA
ATTTGCTGATGGTTCGCTATCTCCTTCT
dot-bracket secondary structure
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no hits
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pta-miR952a
:
0
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no hits
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no hits
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