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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002383
species: Raphanus sativus
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Raphanus sativus Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TACTTCCTCCGTTTCATAATA

miRNA*
TTACGAAACGGAGGGAGTATA

mismatches: 1
bulges: 0

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pre-miRNA
AGTGATAATAATACTTCCTCCGTTTCATAATAGTTGATGTTTTGGAAGGATAATTTTGTTTCAAATTAGATGAAGTTTTGAGATTTTAAGGTTACTTTAG
TTTTATTGGAAACTGTTCAACCAATTAGATTTTACAGTCTTTTTTATTATTGGTTAATTGATTTTAAAATTATATCTTTAAAATATTTTTTAGTTAAAAA
TACAATTTTCTTAATTTTTGTGCACTATGGTAAAACATCAAGTATTACGAAACGGAGGGAGTATATCATAACA


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR819j: 0.00001

PMRD osa-miR819j: 0.00001

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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