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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002658
species: Solanum melongena
miRNA family: MIRf751
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Solanum melongena Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GATCCCTTTGGATGCCTCCTT

miRNA*
GGAGGAGTCCAAAGGGATAGC

mismatches: 2
bulges: 0

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pre-miRNA
GTAGCTCCAAAAGGAGGAGTCCAAAGGGATAGCATGATCCAATTCAATATTTTTTTTATGTAATAGATTATATGTTGTTTGGATACTTCAAAATTATGCA
CAATACGTGTTGAATCCTTCAAAAGAATAGTATATTTTTAAAAGATCTAATCGATACAGGCCTGACAACATTTTGGAGAGTTCAAGCAACATAATAAATA
GAAAGTTATATTACTTGAACTCTCACAAAAAAAAATATTATTGTATCCATGTTAAACCTTCCAAAAATACAATATCTTGAAGAATTTAACATGTACCTGT
CGATATTCTTGAAAAATCTGAACAACGTATATAGAGATTGGATCAATGCGATCCCTTTGGATGCCTCCTTAAGTTGCTT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase mtr-MIR393: 0.000000000005

PMRD mtr-miR393: 0.000000000005

microPC miR393: 0.00002
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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