ABOUT THIS RECORDspecies: Trifolium pratense
miRNA family: MIR157
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGAGAGAAGAGAGAGAGCTA miRNA* GCTATCTTTTTCTTTTCTTTTTT mismatches: 1 bulges: 2 |
pre-miRNA
GAGGTTTAGACAATTAGAAAGAGTAAAAGAAATGAGAGAAGAGAGAGAGCTAAAGAAAATGCTCAATGAAACAAAACAATTCAATTCCAATAACATTACT
ACTCCAAGTTATGATTATGATCAATCAACAAGGTTGTTTTCTTCCAACCATGAATTGATTATTCCATCACGATCATCATCACCACCTCATGTTTCTCTTT
CTCTTTGGCCAACAACATCACAGGTACAACAAGAGGAGTACTTTACAAGTTTGAAGAATCCAATTTCAATGAACTTATGCACTACAAATTATCCACAAAA
CATGCAATCTTCATGGAAGAATGGTTATGATTGTGACTCTTCCTCTGATTCTGGTGTTGACACTTCTCTTCACCTTTGAAAGAATCCATATATAGTTTAA
TCATGTAGCCTCTTCATTATCTAGTGAGTAATGATTGTGACACAATAGCTATCTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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