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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002744
species: Trifolium pratense
miRNA family: MIR838
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTTTCTTCTTCTTCTTCCATG

miRNA*
 TGAAAGATGATTTGAAAGCA

mismatches: 5
bulges: 1
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pre-miRNA
 CCTTTAATCCCAATTCATCCTTTTTCTTCTTCTTCTTCCATGGCTACTTGTATTGATTCTTCATCCCCTCCTATTTCTCGTAAACCTAATGTTTCTCATC
ATCAACCTGATGATTGTTCATTCAACTTTGCCAAATTCTGTCGACCCACTTTTTCTGATCATGTTTCCTCTGTACCCATTTCAATTAATCATGAAAAAAC
CTTACAAACAAAAACCATTGTAGATGATTTTCAACATCTTCATGTTAATGATGATGTTAAGAATGATGTTGAAAATGATGTTGGTGTTGGTGTTATTGAT
GATGTTGAGGTTGATTTGTGGTTGAAGATTCAAGAAGAAGCAAGGTTAGATTTAGATAAAGAACCAATTTTATCTAGCTATTATTTCAGCTCAATTTTAT
CTCACAAATCATTAGAAAGTGCTTTATGTAATCAACTTTCAATTCATTTGAGTAATTTGAGTCTTTCTAGCACAACCCTTTTTGAACTTTTCATGAGTAT
TTTGAATAATGATGAAGATATTATAAGTGCTATGAAAGATGATTTGAAAGCAGTGAAAGAAAGAGACCCT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt sp|Q39218|SAT3_ARATH: 0.000000005

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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