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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002748
species: Trifolium pratense
miRNA family: MIR414
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TCATCGTCATCATCTTCATCA

miRNA*
NNTGTGGATGTGGCGNTGAAG

mismatches: 3
bulges: 2

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pre-miRNA
TCATCTTCAAACTCTCCATCATCATCGTCATCATCTTCATCATCTCCTGCAGCCCGGGGGATCCACTAGTCTAGAGCGAGCCCCCCCTCGAGGTCGACGG
TATCGATAAGCTTGATATCGTTCAGAGGGGATTTTGCTTCCCTGATCAGACTGTCTAGTAGGCTTCTCCAGAGTTATGAGTGATGTTGACTCCCCATGAT
TTCTATCAGGTTGGATCTCCATCCATTTCTCCTTGTCCATCTCAGTTGTGTGTTAAGCAATTACCACAAGATTATGTGTTAACTTTTCAACTAAATCTTT
TAAAACATGACATTCTCCAACAACAGCCTTCTCTATGTCTGATTGGCATCCAAAGATCCAATTTCAGGGAAGATTTCAAACATGCAAGATCAAAATTTGA
GGAATTGAACCCACCATAGAAGCTTTTGAAATCGAAAGAATGAATCGGCGAGGATGCTTCACTGAGTGAGAAGCGCGNAAGAATAAAGGCNGCGGACAAT
TTCGAGTGATTTGTANGTGTGATGNNTGTGGATGTGGCGNTGAAGGAGAGATGGTGTGGTGGC


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD sbi-miR169d: 0.0001

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
Source sequences
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