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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002826
species: Volvox carteri
miRNA family: MIRf117
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Volvox carteri Volvox Volvocaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TCTACCGCCGCCGCTGCCGGC

miRNA*
TGGTGGTGGTGGTGGTAAAGT

mismatches: 1
bulges: 0

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pre-miRNA
GGCAGCGGCTCTACCGCCGCCGCTGCCGGCGCCGCCGCCAGTGGCGGCGGTTGCTGTTGCGGCGGCTGCCGGGTCGTCCGCGGAAGGCTAGCGGCAATCC
GCCGGGACCCCGCTGCGGCCCACCCCCGCCGGGGGGGGAAGGGCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCTGCAGTGGCCGATGGGCACTAATGAGGGGGATGAGGA
GGTGGGAATTCTGTGCAGCAGCAGCAGGTTAAGCTGAATGAGCAAGTGGGTCGCTACGTCCAAAGCACCAACTACCAACTGCCAACTGCCACGGGAGTCT
GGAGGAGCGGGAGACGACGGGTGTGGCGACGATGGGCAGCTGAGCGTTGCCGGCGCTAGCAGCAACAGCAACAACAGCAAGAGCAGCAAGAACAGCAGCA
AGAGCGGCACAAATGTGACGCCAGCAGCAGTAACAGCAGCAGTAAGAATCATAACAGCATGGACACAGCAATTGTAGTAAGGGTGGGAGTGCAGCTGTAC
GGCGGGTATTGTACGGGGTGACGTTATGGGTTGGGGAATGGGGAGAGATCGGGGGAGGGGGGGGGTTGCGCGAGGTATAGGGGCGTGTGAAGGGCCACAG
AGGCGGTGAGTCATATCTCCGATGACCCGGGCGCCAGCTGGTGGTGGTGGTGGTAAAGTGGTGGA


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
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