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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST002846
species:
Zingiber officinale
miRNA family:
MIRf756
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zingiber officinale
Zingiber
Zingiberaceae
Zingiberales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
AGATCATCTGGCAGTTTCAAT
miRNA*
TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG
mismatches:
1
bulges:
1
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pre-miRNA
TAAATTGTTGGAATGAAGAGGT
TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG
TCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAGA
AGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATCT
TCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGGA
AGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTAATTTATTGATCTATCAATTGTTTTCCTCTATCTGAAAGTCTAACAATGAT
TGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATC
AGATCATCTGGCAGTTTCAAT
CCCTCAATTTCCCAACAGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
sbi-MIR167c
:
0.000000007
PMRD
vvi-miR167a
:
0.000000007
microPC
miR167
:
0.00003
UniProt
no hits
RFAM
MIR167_1: 0.0000001
most similar mature miRNAs
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
Source sequences
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