ABOUT THIS RECORDspecies: Cenchrus ciliaris
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Cenchrus ciliaris Cenchrus Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAAGTTACAGAATTTTGACTT miRNA* GTCAAACTTCTCTAGCTTTGA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATGCTGGTCGTTTGGTTTCTTTTTCTTTAAGTCAAACTTCTCTAGCTTTGACCAAGTTTATAGAAAGTGCGCCAAAATCGACAGCATCAAATTGGTTTAA
TTAAATCCATCTTAATATATCTTGACAGTACATTTATTTGGATTATAGATGTTAATATTTTTCAATAAACTTGGTCAAAGTTACAGAATTTTGACTTAGG
ACAAAACTAAATGACCTAAATTTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR437: 1e-17 PMRD pci-miR437: 1e-39 microPC miR437: 0.0000002 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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