ABOUT THIS RECORDspecies: Centaurea maculosa
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Centaurea maculosa Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTTGGGACCGAGGGAGTACT miRNA* TATTCCCTCCACCCCAAGATA mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAATCATAATTTTTATTCCCTCCACCCCAAGATAAATCATAAATGTCTGCAGTGGAAAAGGCACCCTGTTTTAGAAATTTGTAATTTTTATACTATTTAA
TTAACTAAATGACGAATTCATCCCTAATAATAGAGGGGGTAATGATTATCTCCATCTCATGATCAAGGGTAGAATTGGGAAGTAGTTGCTTACTTTTGAA
AATGAATGCTTATTTTGGGACAGACTAAGATAGAAACGTGGACGCTTATTTTGGGACCGAGGGAGTACTATTTTTGATG
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf10099-akr: 0.0009 microPC miR1439: 0.0009 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00007 | most similar mature miRNAs |
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